Hoja de vida

Par evaluador reconocido por Minciencias.
Categoría Investigador Junior (IJ) con vigencia hasta la publicación de los resultados de la siguiente convocatoria
Nombre José Aldemar Usme Ciro
Nombre en citaciones USME CIRO, JOSÉ ALDEMAR
Nacionalidad Colombiana
Sexo Masculino
Código ORCID
Author ID SCOPUS

Formación Académica

  •  
  • Doctorado UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA
    Doctorado en Biología
    Febrerode2008 - Juniode 2013
    Biología Molecular del Virus Dengue: Desarrollo de un Clon Infeccioso, un Replicón y un Vector Viral para el Estudio de la Biología Viral, Evaluación de Compuestos Antivirales y la Potencial Liberación de microRNAs Terapéuticos
  •  
  • Maestría/Magister UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA
    Maestría en Biología
    Febrerode2005 - Abrilde 2008
    Patrón Evolutivo y Filogeográfico del Virus Dengue tipo 1 y 2 en Colombia
  •  
  • Pregrado/Universitario UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA
    Biología
    Abrilde1997 - Diciembrede 2003
    Kappa caseína y su asociación con el recuento de células somáticas en ganado Holstein
  •  
  • Secundario Concentración Educativa León XIII

    Enerode1990 - Diciembrede 1996

    Formación Complementaria

  •  
  • Cursos de corta duración UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA
    EMBO WORLD PRACTICAL COURSE: ADVANCED BIOINFORMATIC METHODS IN THE STUDY OF GENE & GENOME EVOLUTION
    Agostode2009 - Agostode 2009
  •  
  • Cursos de corta duración UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA
    Taller de Transferencia de Tecnología en Diagnósti
    Enerode2004 - de 2004
  •  
  • Cursos de corta duración UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA
    Microscopía Confocal e Imagenología de Células Vivas
    Octubrede2012 - Octubrede 2012
  •  
  • Cursos de corta duración UNIVERSIDAD DEL VALLE
    I Taller en Diagnóstico y Patogénesis de Dengue
    Octubrede2008 - Octubrede 2008
  •  
  • Cursos de corta duración UNIVERSIDAD COOPERATIVA DE COLOMBIA
    Escuela para la Excelencia Educativa
    Juliode2017 - Juliode 2017
  •  
  • Cursos de corta duración Centro Nacional de Salud Pública - Instituto Nacional de Salud
    Capacitación Especializada en Diagnóstico de Dengue y Fiebre Amarilla
    Octubrede2013 - Octubrede 2013
  •  
  • Cursos de corta duración UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA
    I Interactive Research Training Course for Functio
    Enerode2007 - de 2007
  •  
  • Cursos de corta duración CORPORACIÓN PARA INVESTIGACIONES BIOLÓGICAS
    Curso de Genética Estadística y Bioinformatica
    Enerode2006 - de 2006
  •  
  • Cursos de corta duración UNIVERSIDAD COOPERATIVA DE COLOMBIA
    Análisis e Interpretación de Datos
    Septiembrede2016 - Septiembrede 2016
  •  
  • Cursos de corta duración UNIVERSIDAD NACIONAL DE COLOMBIA SEDE MEDELLÍN
    Linux para Sistemáticos
    Enerode2007 - de 2007
  •  
  • Cursos de corta duración UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA
    IV Curso Nacional de Neurobiología Celular y Molec
    Enerode2007 - de 2007
  •  
  • Cursos de corta duración Institut Pasteur de Montevideo - URUGUAY
    Viral Vectors as Genetic Vaccines against Pathogen
    Enerode2008 - de 2008
  •  
  • Cursos de corta duración UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA
    El Museo Actual: Conceptualización y Práxis
    Enerode2001 - de 2001
  •  
  • Cursos de corta duración SERVICIO NACIONAL DE APRENDIZAJE SENA
    Curso de Formación Pedagógica Básica
    Enerode2004 - de 2004
  •  
  • Cursos de corta duración Applied Biosystems y Exogena
    Manejo Básico del Analizador Genético 3130 y sus Aplicaciones en Análisis de Secuencias
    Septiembrede2013 - Septiembrede 2013
  •  
  • Extensión UNIVERSIDAD COOPERATIVA DE COLOMBIA
    Diplomado Ruta de Competencias Digitales Implementación de las TIC en el aula de clase
    Agostode2017 - Noviembrede 2017
  •  
  • Extensión INSTITUTO NACIONAL DE SALUD
    - I Taller de Abordaje Integral de la Circulación de Poxvirus en Colombia
    Juliode2015 - Juliode 2015
  •  
  • Extensión Universidad de La Salle
    Diplomado en Didáctica de las Ciencias Básicas
    Abrilde2015 - Enerode 2016
  •  
  • Extensión UNIVERSIDAD COOPERATIVA DE COLOMBIA
    Diploma Evaluación por Competencias en Educación Superior
    Octubrede2016 - Abrilde 2017
  •  
  • Extensión J. Craig Venter Institute
    Virus Pathogen Resourse Hands-on Workshop
    Marzode2014 - Marzode 2014
  •  
  • Extensión UNIVERSIDAD INDUSTRIAL DE SANTANDER
    II Curso Internacional de Intervención Integral del Dengue
    Agostode2014 - Agostode 2014
  •  
  • Extensión INSTITUTO NACIONAL DE SALUD
    I Taller para el Fortalecimiento del Diagnóstico y Vigilancia de las Hepatitis Virales
    Agostode2014 - Agostode 2014
  •  
  • Extensión Organización Panamericana De La Salud.
    Taller sobre Manejo Clínico y Diagnóstico del Virus Chikungunya
    Septiembrede2014 - Septiembrede 2014
  •  
  • Extensión CENTERS FOR DISEASE CONTROL AND PREVENTION
    Taller sobre escritura de manuscritos científicos
    Septiembrede2014 - Octubrede 2014

    Experiencia profesional

  •  
  • UNIVERSIDAD COOPERATIVA DE COLOMBIA
    Dedicación: 40 horas Semanales Julio de 2016 de Actual

    Actividades de docencia
    -   Pregrado - Nombre del curso:  Infectología, 40 Julio 2016 Enero
  •  
  • Universidad de La Salle
    Dedicación: 40 horas Semanales Enero de 2015 Julio de 2016

  •  
  • INSTITUTO NACIONAL DE SALUD
    Dedicación: 10 horas Semanales Agosto de 2013 de Actual

  •  
  • UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA
    Dedicación: 40 horas Semanales Agosto de 2011 Enero de 2013

  •  
  • Grupo De Neurociencias De Antioquia
    Dedicación: 40 horas Semanales Junio de 2007 Enero de 2013

    Actividades de investigación
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Diseño, Construcción y Evaluación de un Vector Viral Basado en el Virus Dengue para el Tratamiento de Enfermedades Neurodegenerativas Enero 2008
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Development of RNAi as Treatment for Neurodegeneration Agosto 2007
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Agosto 2007
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Enero 2006 Agosto 2007
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Evaluación del Potencial Terapéutico de Inhibidores de la Isoprenilación de las Rho GTPasas en Cultivos Infectados con el Virus Dengue Enero 2006
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Papel del Citoesqueleto en la Infección por el Virus Dengue Enero 2005 Diciembre 2006
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Epidemiología Molecular del Virus Dengue en Colombia 1977-2004 y Vigilancia de Genotipos Circulantes 2005-2006 Enero 2005 Enero 2008
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Caracterización de Aislados Clínicos del Virus del Dengue en Antioquia con Énfasis en su Potencial Hemorrágico Abril 2004 Abril 2005
  •  
  • UNIVERSIDAD DEL QUINDÍO
    Dedicación: 8 horas Semanales Noviembre de 2007 Noviembre de 2007

    Actividades de administración
    -  Miembro de consejo de centro - Cargo: Otro (especifique) Noviembre de 2007 Noviembre de 2007
  •  

  • Dedicación: 0 horas Semanales Noviembre de 2007 Noviembre de 2007

    Actividades de docencia
    -   Extensión extracurricular - Nombre del curso:  Participación como docente organizador del I Curso Teórico- Práctico: Técnicas Celulares y Moleculares para el Diagnóstico y Epidemiología del Virus Dengue (Intensidad: 30 horas),  Noviembre 2007 Noviembre 2007
  •  
  • Instituto De Salud Carlos Iii
    Dedicación: 48 horas Semanales Febrero de 2006 Mayo de 2006

  •  
  • INSTITUTO NACIONAL DE SALUD
    Dedicación: 0 horas Semanales Enero de 2005 Enero de 2008

    Actividades de investigación
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Apoyo en actividades de investigación en virología Agosto 2016 Noviembre
  •  

  • Dedicación: 0 horas Semanales Junio de 2005 Enero de 2006

    Actividades de investigación
    -   Pasantías - Titulo:  Enero 2006 Enero 2006
    -   Pasantías - Titulo:  Junio 2005 Agosto 2005
  •  

  • Dedicación: 0 horas Semanales Febrero de 2004 Enero de 2007

    Actividades de investigación
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Febrero 2004 Enero 2007
  •  
  • CORPORACIÓN CENTRO DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA DE ANTIOQUIA
    Dedicación: 4 horas Semanales Abril de 2004 Abril de 2005

    Actividades de administración
    -  Otra actividad técnico-científica relevante - Cargo: Asesoría de equipos escolares de investigación en la ejecución de proyectos aprobados por Colciencias Abril de 2004 Abril de 2005
    -  Miembro de consejo de centro - Cargo: Asesor científico Abril de 2004 Abril de 2005
  •  
  • UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA
    Dedicación: 40 horas Semanales Junio de 2001 Agosto de 2007

    Actividades de administración
    -  Miembro de consejo de centro - Cargo: Participación en proyecto de investigación Abril de 2007 de
    -  Miembro de consejo de centro - Cargo: Participación en proyectos de Investigación Febrero de 2004 Diciembre de 2004
    -  Miembro de consejo de centro - Cargo: Auxiliar administrativo Colección de Ciencias Junio de 2001 Octubre de 2003
    Actividades de docencia
    -   Pregrado - Nombre del curso:  Laboratorio de Biología General,  Febrero 2007 Agosto 2007
    -   Perfeccionamiento - Nombre del curso:  Cátedra en Investigación,  Febrero 2007 Agosto 2007
    -   Pregrado - Nombre del curso:  Módulo Evolución Molecular de Virus (Curso Rotación por Virología) BLR-423,  Enero 2005 Enero 2006
    -   Pregrado - Nombre del curso:  Laboratorio de Biología General,  Enero 2005 Julio 2005
    -   Pregrado - Nombre del curso:  Laboratorio de Biología General,  Enero 2005 Junio 2007
  •  

  • Dedicación: 0 horas Semanales Junio de 2001 Octubre de 2003

    Actividades de docencia
    -   Extensión extracurricular - Nombre del curso:  Auxiliar administrativo,  Junio 2001 Octubre 2003
  •  

  • Dedicación: 0 horas Semanales Octubre de 2001 Octubre de 2003

    Actividades de investigación
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Búsqueda de Asociación entre los Genotipos de kappa-Caseína y la Resistencia/Susceptibilidad a Mastitis Bovina Octubre 2001 Octubre 2003
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Octubre 2001 Octubre 2003

    Áreas de actuación

  •  Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Virología
  •  Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular
  •  Ciencias Médicas y de la Salud -- Biotecnología en Salud -- Biotecnología Relacionada con la Salud
  •  Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Celular y Microbiología
  •  Ciencias Médicas y de la Salud -- Ciencias de la Salud -- Enfermedades Infecciosas
  •  Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología (Teórica, Matemática, Criobiología, Evolutiva)
  •  Ciencias Médicas y de la Salud -- Biotecnología en Salud -- Tecnología para la Identificación y Funcionamiento del ADN, Proteínas y Encimas y como Influencian la Enfermedad
  •  Ciencias Médicas y de la Salud -- Ciencias de la Salud -- Medicina Tropical
  • Idiomas

      Habla Escribe Lee Entiende
  •  Inglés
  • Aceptable Bueno Bueno Aceptable
  •  Español
  • Bueno Bueno Bueno Bueno

    Líneas de investigación

  •  Biología Celular y Molecular de la Infección Viral, Activa:No
  •  Epidemiología Molecular y Filogenética, Activa:No
  •  Genética Animal, Activa:No
  •  Biología Viral, Activa:No
  •  Biología Celular y Molecular, Activa:No
  •  Evolución Molecular, Activa:No
  •  Filogenética, Activa:No
  •  Vectores Virales y Terapia Génica, Activa:Si
  • Reconocimientos

  • Distinción Cum Laude,UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA - Octubrede 2013
  • Premio al mejor trabajo de investigación - V Jornadas de Investigación: Hacia la innovación y apropiación social del conocimiento,UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA - Juniode 2014
  • Mejor Trabajo Libre Modalidad Oral en Virología Humana,Red Colombiana de Virología - Noviembrede 2011
  • apoyo a trabajos de grado para estudiantes de pregrado,UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA - de 2002
  • Beca Estudiante Instructor,UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA - de 2005
  •  
    Los ítems de producción con la marca corresponden a productos avalados y validados para la última Convocatoria Nacional para el Reconocimiento y Medición de Grupos de Investigación, Desarrollo Tecnológico o de Innovación y para el Reconocimiento de Investigadores del SNCTeI

    Asesorías

  • Doble Hélice
  • Institución: Colegio Parroquial Jesus de la Buena Esperanza ,Ciudad: BELLO
  • Bioquímica
  • Institución: Colegio Parroquial Jesus de la Buena Esperanza ,Ciudad: BELLO

    Cursos de corta duración

  • Producción técnica - Cursos de corta duración dictados - Extensión extracurricular
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, II Curso Internacional de Intervención Integral del Dengue, Finalidad: Actualización en Dengue y Chikungunya a la comunidad médica y de virólogos . En: Colombia  ,2014,  ,Red Aedes.  participación: Docente , 1 semanas 
  • Producción técnica - Cursos de corta duración dictados - Extensión extracurricular
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, I curso teórico-práctico: Técnicas Celulares y Moleculares para el Diagnóstico y Epidemiología del Virus Dengue, Finalidad: . En: Colombia  ,2007,  ,UNIVERSIDAD DEL QUINDÍO.  participación: Docente , 1 semanas 
  • Producción técnica - Cursos de corta duración dictados - Extensión extracurricular
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, I Taller para el Fortalecimiento del Diagnóstico y Vigilancia de las Hepatitis Virales, Finalidad: Presentar una actualización en diagnóstico y vigilancia de hepatitis virales a diferentes actores del área de la salud a nivel nacional . En: Colombia  ,2014,  ,INSTITUTO NACIONAL DE SALUD.  participación: Docente , 1 semanas 
    Palabras:
    Dengue, Detección Molecular, Genotipos, Vigilancia,
    Sectores:
    Salud humana - Cuidado a la salud de las poblaciones humanas, Salud humana - Cuidado a la salud de las personas,

    Trabajos dirigidos/tutorías

  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • ALBA MERY GOMEZ CASTANEDA, JOSE ALDEMAR USME CIRO, JUAN CARLOS GALLEGO GOMEZ, Detección Molecular y Serotipificación del Virus Dengue por RT-PCR y PCR Semi-Anidada usando Oligonucleótidos Mejorados  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis concluida  Microbiología y Bioanálisis  ,2007,  . Persona orientada: Alba Mery Gómez Castañeda  , Dirigió como: Tutor principal,  0 meses  
    Areas:
    Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Celular y Microbiología,
    Sectores:
    Salud humana - Cuidado a la salud de las poblaciones humanas,
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, Caracterización molecular de los extremos 5´ y 3´ del genoma del virus dengue y su utilidad en estudios de patogénesis  Universidad de La Salle  Estado: Tesis concluida  Biología  ,2015,  . Persona orientada: Alicia Rosales Munar  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
    Areas:
    Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular,
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, DANIELA ALEJANDRA ARCOS CORREDOR, DETERMINACIÓN DE GENOTIPOS Y SUBTIPOS DEL VIRUS DE LA HEPATITIS C MEDIANTE EL ANALISIS DE LAS REGIONES 5´ UTR Y NS5b POR MEDIO DE RT-PCR EN TIEMPO REAL Y SECUENCIACIÓN, COMO HERRAMIENTA ÚTIL EN EL PRONÓSTICO Y VIGILANCIA DE LA ENFERMEDAD  UNIVERSIDAD COLEGIO MAYOR DE CUNDINAMARCA  Estado: Tesis concluida  Bacteriología y Laboratorio Clínico  ,2014,  . Persona orientada: Daniela Alejandra Arcos Corredor  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
    Areas:
    Ciencias Médicas y de la Salud -- Biotecnología en Salud -- Tecnología para la Identificación y Funcionamiento del ADN, Proteínas y Encimas y como Influencian la Enfermedad, Ciencias Médicas y de la Salud -- Biotecnología en Salud -- Biotecnología Relacionada con la Salud,
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajo de grado de maestría o especialidad clínica
  • CLARA BERMUDEZ, JOSE ALDEMAR USME CIRO, Análisis de Determinantes Genéticos de Virulencia en Cepas de Virus Dengue Tipo 2  INSTITUTO NACIONAL DE SALUD  Estado: Tesis concluida    ,2013,  . Persona orientada: Katherine Dayanna Laiton Donato  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
    Areas:
    Ciencias Médicas y de la Salud -- Ciencias de la Salud -- Enfermedades Infecciosas,
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, JUAN CARLOS GALLEGO GOMEZ, Empaquetamiento del Virus Dengue. Papel del elemento CCR1 en ensayos de trans-complementación con genes estructurales para producir partículas virales pseudo-infecciosas  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis concluida  Biología  ,2014,  . Persona orientada: Juan Pablo Franco Salazar  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
    Areas:
    Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Virología, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular,
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • JUAN DAVID PUERTA ARIAS, JOSE ALDEMAR USME CIRO, JUAN CARLOS GALLEGO GOMEZ, Implementación de un Control Interno para la detección de micoplasmas en cultivos celulares por PCR  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis concluida  Microbiología y Bioanálisis  ,2011,  . Persona orientada: Juan David Puerta Arias  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
    Areas:
    Ciencias Médicas y de la Salud -- Biotecnología en Salud -- Tecnología para la Identificación y Funcionamiento del ADN, Proteínas y Encimas y como Influencian la Enfermedad,
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajo de grado de maestría o especialidad clínica
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, Caracterización fenotípica y Molecular de cepas de dengue aisladas de casos de dengue y dengue grave  INSTITUTO NACIONAL DE SALUD  Estado: Tesis en curso  Maestría en Ciencias - Microbiología  ,2016,  . Persona orientada: Claudia Patricia Palma Villanueva  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, DIEGO ALEJANDRO ALVAREZ DIAZ, Desarrollo y evaluación de un control plasmídico para la serotipificación del virus dengue mediante RT-PCR en tiempo real  INSTITUTO NACIONAL DE SALUD  Estado: Tesis concluida  Biología  ,2016,  . Persona orientada: Paula Alejandra Quintero Cortes  , Dirigió como: Coturor/asesor,  meses  
    Areas:
    Ciencias Médicas y de la Salud -- Biotecnología en Salud -- Biotecnología Relacionada con la Salud,
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajo de grado de maestría o especialidad clínica
  • CLARA ISABEL BERMUDEZ SANTANA, JOSE ALDEMAR USME CIRO, Protocolo Computacional para la Asignación Taxonómica de Virus en Metadatos Genómicos  UNIVERSIDAD NACIONAL DE COLOMBIA  Estado: Tesis en curso  Maestría en Bioinformática  ,2019,  . Persona orientada: Valentina Cobo Paz  , Dirigió como: Coturor/asesor,  meses  
    Areas:
    Ciencias Médicas y de la Salud -- Biotecnología en Salud -- Biotecnología Relacionada con la Salud, Ingeniería y Tecnología -- Ingenierías Eléctrica, Electrónica e Informática -- Ingeniería de Sistemas y Comunicaciones,
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajo de grado de maestría o especialidad clínica
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, JAIME EDUARDO CASTELLANOS PARRA, MARÌA LEONOR CALDAS MARTINEZ, Estudio histopatológico y molecular de casos fatales por dengue en la epidemia de 2010 en Colombia  UNIVERSIDAD NACIONAL DE COLOMBIA SEDE BOGOTA  Estado: Tesis concluida  Maestría en Ciencias - Microbiología  ,2016,  . Persona orientada: Jorge Alonso Rivera Rivera  , Dirigió como: ,  meses  
    Areas:
    Ciencias Médicas y de la Salud -- Ciencias de la Salud -- Medicina Tropical, Ciencias Médicas y de la Salud -- Biotecnología en Salud -- Tecnología para la Identificación y Funcionamiento del ADN, Proteínas y Encimas y como Influencian la Enfermedad,
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajo de grado de maestría o especialidad clínica
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, MARIA CRISTINA NAVAS NAVAS, Diversidad genética y dinámica evolutiva del Virus de la Hepatitis C en pacientes con antecedente transfusional antes de 1996 en Colombia  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis en curso  Maestría en Ciencias Básicas Biomédicas  ,2018,  . Persona orientada: Maria Camila López Osorio  , Dirigió como: Coturor/asesor,  meses  
    Areas:
    Ciencias Médicas y de la Salud -- Biotecnología en Salud -- Tecnología para la Identificación y Funcionamiento del ADN, Proteínas y Encimas y como Influencian la Enfermedad, Ciencias Médicas y de la Salud -- Ciencias de la Salud -- Enfermedades Infecciosas,
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajo de grado de maestría o especialidad clínica
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, WINSTON ROJAS MONTOYA, Análisis de circulación y transmisión activa de arbovirus a partir de saliva y excretas de mosquitos presentes en el distrito de Santa Marta  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis en curso  CIENCIAS BÁSICAS BIOMEDICAS  ,2019,  . Persona orientada: Juan Pablo Franco Salazar  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
    Areas:
    Ciencias Médicas y de la Salud -- Ciencias de la Salud -- Salud Pública, Ciencias Médicas y de la Salud -- Ciencias de la Salud -- Enfermedades Infecciosas,
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Tesis de doctorado
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, Expedición virológica en ecosistemas representativos de Colombia: selva húmeda tropical de la Sierra Nevada de Santa Marta  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis en curso  Doctorado en Ciencias Básicas Biomédicas - énfasis Virología  ,2018,  . Persona orientada: Katherine Dayanna Laiton Donato  , Dirigió como: Coturor/asesor,  meses  
     

    Jurado en comités de evaluación

  • Datos complementarios - Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado - Maestría
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, Titulo: Evidencia de la circulación del virus de la hepatitis A y del virus de la hepatitis E en muestras ambientales en el departamento de Antioquia, Colombia Tipo de trabajo presentado: Trabajo de grado/tesis en:  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  programa académico Maestría en Ciencias Básicas Biomédicas  Nombre del orientado: Paula Andrea Báez Triana  
  • Datos complementarios - Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado - Maestría
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, Titulo: Participación de las proteínas Hrs, TSG101, Alix, CHMP4B y Vps4B del complejo ESCRT en la producción del virus dengue serotipo 2 en células A549 Tipo de trabajo presentado: Proyecto de grado/Tesis en:  UNIVERSIDAD EL BOSQUE  programa académico Maestría en Ciencias Básicas Biomédicas  Nombre del orientado: Claudia Liliana Bueno Angarita  
  • Datos complementarios - Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado - Maestría
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, Titulo: PHYLOGENETIC ANALYSIS OF WILD-TYPE CANINE DISTEMPER VIRUSES CIRCULATING IN DOGS FROM THE ABURRA VALLEY, COLOMBIA Tipo de trabajo presentado: Trabajo de grado/tesis en:  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  programa académico Maestría en Ciencias Animales  Nombre del orientado: María Adelaida Espinal Restrepo  
  • Datos complementarios - Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado - Doctorado
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, Titulo: GENETIC CHARACTERIZATION AND EPIGENETIC INTERFERENCE TO BETTER UNDERSTAND OCCULT HEPATITIS B VIRUS INFECTION Tipo de trabajo presentado: Proyecto de grado/Tesis en:  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  programa académico CIENCIAS BÁSICAS BIOMEDICAS  Nombre del orientado: JULIO CESAR RENDÓN LONDOÑO  
  • Datos complementarios - Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado - Doctorado
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, Titulo: Caracterización clínica, virológica y epidemiológica de la infección por dengue en escolares de Medellín, Antioquia, Colombia Tipo de trabajo presentado: Proyecto de grado/Tesis en:  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  programa académico Doctorado en Biología  Nombre del orientado: Leydi Diana Piedrahita  
  • Datos complementarios - Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado - Maestría
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, Titulo: Evaluación del efecto de la Curcumina sobre la actividad polimerasa de la proteína NS5 del virus dengue 2, en un sistema in vitro Tipo de trabajo presentado: Trabajo de grado/tesis en:  UNIVERSIDAD DEL QUINDÍO  programa académico CIENCIAS BIOMEDICAS   Nombre del orientado: Leydi Lorena García Ariza  
  • Datos complementarios - Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado - Maestría
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, Titulo: COINFECCIÓN DEL VIRUS DE LA HEPATITIS E CON OTRAS HEPATITIS VIRALES EN COLOMBIA Y SU CARACTERIZACIÓN GENOTÍPICA Tipo de trabajo presentado: Trabajo de grado/tesis en:  UNIVERSIDAD NACIONAL DE COLOMBIA  programa académico Maestría en Ciencias - Biología  Nombre del orientado: Daniel Augusto Martinez Vargas  
  • Datos complementarios - Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado - Maestría
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, Titulo: ASOCIACIÓN ENTRE NIVELES DE VITAMINA D Y LA RESPUESTA INMUNOLÓGICA INESPECIFICA EN SUJETOS CON DIAGNOSTICO DE DENGUE Tipo de trabajo presentado: Trabajo de grado/tesis en:  UNIVERSIDAD DEL QUINDÍO  programa académico CIENCIAS BIOMEDICAS   Nombre del orientado: MARGARITA MARIA CARDONA CORDOBA  

    Participación en comités de evaluación

  • Datos complementarios - Participación en comités de evaluación - Concurso docente
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, CONCURSO DOCENTE PARA SELECCIONAR PROFESORES DE CARRERA AÑO 2013
    en:  UNIVERSIDAD INDUSTRIAL DE SANTANDER 
  • Datos complementarios - Participación en comités de evaluación - Otra
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, Participación en panel de Virus y Vectores, Programa de Ciencias Básicas, Colciencias
    en:  Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación 

    Par evaluador

    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: UNIVERSIDAD DE PAMPLONA,  2015,  Octubre  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación,  2015,  Octubre  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: UNIVERSIDAD INDUSTRIAL DE SANTANDER,  2015,  Noviembre  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación,  2015,  Enero  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Material para publicación científica  Revista: Revista MVZ Cordoba,  2014,  Octubre  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: UNIVERSIDAD INDUSTRIAL DE SANTANDER,  2010,  Diciembre  
    Ámbito: Internacional  Par evaluador de: Material para publicación científica  Revista: PLoS ONE,  2014,  Agosto  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Material para publicación científica  Revista: Revista De Investigaciones En Medicina Tropical,  2014,  Junio  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: Banco De La República - Bogotá,  2014,  Diciembre  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Material para publicación científica  Revista: Salud Uninorte,  2012,  Agosto  
    Ámbito: Internacional  Par evaluador de: Material para publicación científica  Revista: BMC Microbiology,  2012,  Diciembre  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: UNIVERSIDAD DE LOS ANDES,  2016,  Septiembre  
    Ámbito: Internacional  Par evaluador de: Material para publicación científica  Revista: Memorias do Instituto Oswaldo Cruz,  2017,  Enero  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: Banco De La República - Bogotá,  2016,  Mayo  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Material para publicación científica  Revista: Biomedica,  2015,  Diciembre  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Material para publicación científica  Revista: Biomedica,  2016,  Octubre  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA,  2017,  Diciembre  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: UNIVERSIDAD COOPERATIVA DE COLOMBIA,  2017,  Noviembre  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Material para publicación científica  Revista: Biomedica,  2017,  Julio  
    Ámbito: Internacional  Par evaluador de: Material para publicación científica  Revista: Virus Research,  2018,  Enero  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: Fundación Para La Promoción De La Investigación Y La Tecnología,  2017,  Julio  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: OBSERVATORIO COLOMBIANO DE CIENCIA Y TECNOLOGIA (OCYT),  2018,  Mayo  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: Banco De La República - Bogotá,  2016,  Marzo  

    Eventos científicos

    1 Nombre del evento: Primer Simposio de Investigación en Epidemiología y Patogénesis Molecular de Enfermedades Tropicales  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Nacional  Realizado el:2016-04-19 00:00:00.0,  2016-04-20 00:00:00.0   en BOGOTÁ, D.C.   - Universidad de La Salle  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:El genoma del virus dengue y su contribución a la patogénesis del dengue grave Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Conferencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidad de La Salle Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Organizador , Ponente magistral
    2 Nombre del evento: I Taller de Abordaje Integral de la Circulación de Poxvirus en Colombia  Tipo de evento: Taller  Ámbito: Nacional  Realizado el:2015-07-21 00:00:00.0,  2015-07-24 00:00:00.0   en BOGOTÁ, D.C.   - Instituto Nacional de Salud  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Caracterización molecular de poxvirus zoonóticos en Caquetá, Colombia, 2014 Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Conferencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:CENTERS FOR DISEASE CONTROL AND PREVENTION Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    • Nombre de la institución:INSTITUTO NACIONAL DE SALUD Tipo de vinculaciónGestionadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Ponente magistral
    3 Nombre del evento: International Conference on Emerging Infectious Diseases ¿ ICEID 2015  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2015-08-24 00:00:00.0,  2015-08-26 00:00:00.0   en Atlanta   - Hyatt Regency Atlanta  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Molecular characterization of zoonotic poxviruses circulating in the amazon region of Colombia Tipo de producto:Demás trabajos - Demás trabajos - Póster
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:CENTERS FOR DISEASE CONTROL AND PREVENTION Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Ponente
    4 Nombre del evento: V Simposio Nacional de Virología y I Congreso Latinoamericano de Virología  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2013-11-19 00:00:00.0,  2013-11-21 00:00:00.0   en QUIBDÓ   - Auditorio Felix Restrepo  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Uso de Oligonucleótidos Degenerados para la Detección Molecular y Tipificación del Virus Dengue por RT-PCR y PCR Anidada Tipo de producto:Demás trabajos - Demás trabajos - Póster
    • Nombre del producto:Uso de Oligonucleótidos Degenerados para la Detección Molecular y Tipificación del Virus Dengue por RT-PCR y PCR Anidada Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    • Nombre del producto:Epidemiología Molecular del Virus Dengue Tipo 4 en Colombia, 1982-2013 Tipo de producto:Demás trabajos - Demás trabajos - Póster
    • Nombre del producto:Epidemiología Molecular del Virus Dengue Tipo 4 en Colombia, 1982-2013 Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:PONTIFICIA UNIVERSIDAD JAVERIANA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Asistente , Ponente
    5 Nombre del evento: I Taller para el Fortalecimiento del Diagnóstico y Vigilancia de las Hepatitis Virales  Tipo de evento: Taller  Ámbito: Nacional  Realizado el:2014-08-27 00:00:00.0,  2014-08-29 00:00:00.0   en BOGOTÁ, D.C.   - Ministerio de Salud y Protección Social  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Utilidad de los datos moleculares en la genotipificación y análisis filogenético de las hepatitis virales Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    • Nombre del producto:Aplicación de la biología molecular al diagnóstico de las hepatitis virales Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:INSTITUTO NACIONAL DE SALUD Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Ponente
    6 Nombre del evento: Taller sobre escritura de manuscritos científicos  Tipo de evento: Taller  Ámbito: Internacional  Realizado el:2014-09-29 00:00:00.0,  2014-10-03 00:00:00.0   en BOGOTÁ, D.C.   - Instituto Nacional de Salud  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:CENTERS FOR DISEASE CONTROL AND PREVENTION Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Asistente
    7 Nombre del evento: II Curso Internacional de Intervención Integral del Dengue  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Internacional  Realizado el:2014-08-13 00:00:00.0,  2014-08-16 00:00:00.0   en BUCARAMANGA   - Hotel Chicamocha  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Utilidad de la Biología Molecular en el Diagnóstico y Vigilancia del Dengue Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Red Aedes Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Ponente
    8 Nombre del evento: VI Simposio Colombiano de Virología  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Nacional  Realizado el:2015-05-27 00:00:00.0,  2015-05-29 00:00:00.0   en BOGOTÁ, D.C.   - Universidad de La Salle  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Rosales AA, Usme-Ciro JA. C-114. El virus Usutu, una posible amenaza para la biodiversidad en Colombia Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    • Nombre del producto:Cordero-Rodríguez M, Usme-Ciro JA. C-113. El virus Lassa: potencial amenaza para las Américas Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    • Nombre del producto:Melgarejo-Colmenares JK, Usme-Ciro JA. C-112. El virus de la influenza aviar A (H7N9): su tránsito de virus local a posible amenaza mundial Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    • Nombre del producto:Muñoz-Gamba A, Usme-Ciro JA. C-111. El dengue 5 y sus implicaciones en salud pública Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    • Nombre del producto:Gracia M, Acero F, Laiton K, Usme-Ciro JA, Páez A. C-043. Técnicas de laboratorio utilizadas para el diagnóstico y la vigilancia de los virus de la rabia en Colombia Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    • Nombre del producto:Arcos-Corredor D, Páez A, Usme-Ciro JA. C-083. Diseño, construcción y evaluación de un control plasmídico en la detección y genotipificación del virus de la hepatitis C mediante PCR con transcripción inversa en tiempo real Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    • Nombre del producto:Laiton-Donato K, Rico A, Pardo L, González M, Martínez C, Usme-Ciro JA, Páez A. C-068. Análisis filogenético del virus del chikunguña en Colombia Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    • Nombre del producto:Laiton-Donato K, Páez A, Usme-Ciro JA. C-056. Análisis de determinantes genéticos de la virulencia en cepas del virus del dengue de tipo 2 Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    • Nombre del producto:Rico-Turca AM, Pardo LC, Martínez JC, Laiton K, Usme J, Páez A, Beltrán-Durán M. PL-36. Vigilancia por laboratorio del virus del chikunguña en Colombia, 2014-2015 Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    • Nombre del producto:Martínez-Vargas D, Usme-Ciro JA, Escalante MP, Palacios-Vivero M, Contreras-Gómez L, Peláez-Carvajal D. PE-28. Infección concomitante con el virus de la hepatitis E y otros agentes de hepatitis virales en Colombia Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    • Nombre del producto:Usme-Ciro JA, Paredes A, Walteros DM, Tolosa N, Pinzón MC, Petersen BW, Gallardo-Romero NF, Wilkins YK, Satheshkumar PS, Patel N, Páez A. PE-16. Caracterización molecular de poxvirus zoonóticos en Caquetá, Colombia, 2014 Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    • Nombre del producto:Muñoz-Gamba A, Usme-Ciro JA. C-111. El dengue 5 y sus implicaciones en salud pública Tipo de producto:Demás trabajos - Demás trabajos - Póster
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidad de La Salle Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    • Nombre de la institución:INSTITUTO NACIONAL DE SALUD Tipo de vinculaciónGestionadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Asistente , Compilador de memorias , Organizador , Ponente
    9 Nombre del evento: I Simposio Nacional de Virología  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Nacional  Realizado el:2004-09-03 00:00:00.0,  2004-09-05 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:El Citoesqueleto en la Infección por Virus Dengue Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Asistente
    10 Nombre del evento: VIII Simposio PECET: Avance en la Investigación de Enfermedades Tropicales  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Nacional  Realizado el:2007-03-27 00:00:00.0,  2007-03-29 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Sede de Investigación Universitaria, Universidad de Antioquia  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Molecular Epidemiology and Identification of two Genotypes of Dengue Virus Serotype-3 circulating in Colombia Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    • Nombre del producto:Implementación de Primers Degenerados en la Técnica RT-PCR y PCR Semi-Anidada para la Detección y Serotipificación del Virus Dengue Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    • Nombre del producto:Molecular Epidemiology and Identification of two Genotypes of Dengue Virus Serotype-3 circulating in Colombia Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Programa De Estudio Y Control De Enfermedades Tropicales Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Ponente
    11 Nombre del evento: VII ENCUENTRO NACIONAL DE NEUROCIENCIAS / VIII ENCUENTRO INTERNACIONAL DE NEUROCIENCIAS  Tipo de evento: Encuentro  Ámbito: Internacional  Realizado el:2010-04-24 00:00:00.0,  2010-04-26 00:00:00.0   en IBAGUÉ   - Universidad del Tolima  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Diseño de un nuevo vector viral basado en virus dengue potencialmente útil como vehículo para terapia de silenciamiento génico en desórdenes neurodegenerativos Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    • Nombre del producto:Diseño de un nuevo vector viral basado en Virus Dengue potencialmente útil como vehículo para el silenciamiento génico en desórdenes neurodegenerativos Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD DEL TOLIMA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Asistente , Ponente
    12 Nombre del evento: III Simposio de la Red Colombiana de Biología Evolutiva  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Nacional  Realizado el:2011-07-01 00:00:00.0,  2011-07-01 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Parque Explora  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Historia Evolutiva del Virus Dengue en Colombia Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    • Nombre del producto:Historia Evolutiva del Virus Dengue en Colombia Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Red Colombiana de Bilogía Evolutiva Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Asistente , Ponente
    13 Nombre del evento: The 23rd Latin American Symposium at the 79th Annual Meeting  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Internacional  Realizado el:2013-02-24 00:00:00.0,  2013-02-28 00:00:00.0   en Atlantic City   - Atlantic City  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Identification of dengue virus in natural populations of Aedes aegypti from Colombia during interepidemic periods Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:American Mosquito Control Association Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Asistente
    14 Nombre del evento: 32nd Annual American Society for Virology  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2013-07-20 00:00:00.0,  2013-07-24 00:00:00.0   en Pennsylvania   - The Pennsylvania State University  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Development of a novel DNA-launched dengue virus type 2 infectious clone assembled in a bacterial artificial chromosome Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    • Nombre del producto:Development of a novel DNA-launched dengue virus type 2 infectious clone assembled in a bacterial artificial chromosome Tipo de producto:Demás trabajos - Demás trabajos - Póster
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:The Pennsylvania State University Tipo de vinculaciónGestionadora
    • Nombre de la institución:Americna Society of Virology Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Asistente , Ponente
    15 Nombre del evento: XIV Congress of the European Society for Evolutionary Biology  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2013-08-19 00:00:00.0,  2013-08-24 00:00:00.0   en Lisboa   - Lisboa  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Experimental evolution of an RNA virus in mixed host environments Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    • Nombre del producto:Experimental evolution of an RNA virus in mixed host environments Tipo de producto:Demás trabajos - Demás trabajos - Póster
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD DE LISBOA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Asistente
    16 Nombre del evento: IV Simposio Nacional de Virología  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Nacional  Realizado el:2011-11-01 00:00:00.0,    en MEDELLÍN   - Sede de Investigación Universitaria  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Diseño, construcción y evaluación de un cDNA infeccioso del virus dengue clonado en cromosoma artificial bacteriano bajo el control de un promotor eucariota Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    • Nombre del producto:Construcción de un replicon subgenómico de virus dengue y una línea celular estable para la trans-complementación y generación de partículas infecciosas bioseguras Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Organizador
    17 Nombre del evento: II Simposio Nacional de Virología  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Nacional  Realizado el:2006-09-07 00:00:00.0,  2006-09-10 00:00:00.0   en BOGOTÁ, D.C.   - Universidad El Bosque, Bogotá  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Evolución experimental del Virus Dengue Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    • Nombre del producto:Avances en el diagnóstico de la Fiebre Amarilla Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    • Nombre del producto:Clonajes de genes estructurales y no estructurales del Virus Dengue Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    • Nombre del producto:Evolución experimental del Virus Dengue Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    • Nombre del producto:Epidemiología molecular del Virus Dengue en Colombia 1977-2004 y vigilancia de genotipos circulantes 2005-2006 Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    • Nombre del producto:Genotipificación de cepas colombianas del Virus Dengue tipo 3 Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Asistente , Ponente
    18 Nombre del evento: I Congreso Latinoamericano de Bioética  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2003-01-01 00:00:00.0,    en RIONEGRO   -  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD PONTIFICIA BOLIVARIANA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Organizador
    19 Nombre del evento: III TALLER IBEROAMERICANO EN VIROSIS EMERGENTES, RIVE - CYTED  Tipo de evento: Taller  Ámbito: Internacional  Realizado el:2007-04-23 00:00:00.0,  2007-04-27 00:00:00.0   en Lima   - Laboratorio de Biomedicina, Instituto Nacional de Salud  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Kappa Casein Gene and Its association with somatic cell count in Holstein Cattle Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Red Iberoamericana de Virosis Emergentes - RIVE Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    • Nombre de la institución: Instituto Nacional de Salud, Lima - Perú Tipo de vinculaciónGestionadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Organizador
    20 Nombre del evento: II CONGRESO INTERNACIONAL DE APLICACIONES EN CITOMETRÍA DE FLUJO  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2006-06-01 00:00:00.0,  2006-06-01 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Sede de Investigación Universitaria, Universidad de Antioquia  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:BEKTON DICKINSON Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Asistente
    21 Nombre del evento: Virus Pathogen Resourse Hands-on Workshop  Tipo de evento: Taller  Ámbito: Internacional  Realizado el:2014-03-07 00:00:00.0,  2014-03-07 00:00:00.0   en Boston   - Massachusetts Institute of Technology  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:J. Craig Venter Institute Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Asistente
    22 Nombre del evento: II Congreso Internacional y V Congreso Colombiano de Genética  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2002-01-01 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   - Universidad Nacional de Colombia  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:ASOCIACION COLOMBIANA DE GENETICA HUMANA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Organizador
    23 Nombre del evento: III Simposio Nacional de Virología  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Nacional  Realizado el:2008-04-01 00:00:00.0,  2008-04-01 00:00:00.0   en CALI   - Facultad de Salud, Universidad del Valle  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD DEL VALLE Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Asistente
    24 Nombre del evento: VII Encuentro Nacional de Investigadores de las Ciencias Pecuarias  Tipo de evento: Encuentro  Ámbito: Nacional  Realizado el:2003-04-01 00:00:00.0,  2003-04-03 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Facultad de Ciencias Agrarias  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Kappa Casein Gene and Its association with somatic cell count in Holstein Cattle Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    • Nombre del producto:Kappa Casein Gene and Its association with somatic cell count in Holstein Cattle Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Asistente , Ponente
    25 Nombre del evento: Primeras Jornadas de Computación Científica y Cálculo Distribuido  Tipo de evento: Encuentro  Ámbito: Nacional  Realizado el:2007-01-01 00:00:00.0,    en MEDELLÍN   - Sede de Investigación Universitaria  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Organizador
    26 Nombre del evento: XVII Congreso Nacional ANECB. Cambio Climático Global: Implicaciones para la Conservación de los Recursos Naturales  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2003-01-01 00:00:00.0,    en MEDELLÍN   - Teatro Camilo Torres, Universidad de Antioquia  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Asociación Nacional De Estudiantes De Ciencias Biológicas Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Organizador
    27 Nombre del evento: VI Encuentro Nacional de Neurociencias / VII Seminario Internacional de Neurociencias  Tipo de evento: Encuentro  Ámbito: Nacional  Realizado el:2008-01-01 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   - Centro de Convenciones Alfonso Lopez Pumarejo, Universidad Nacional de Colombia  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:COLNE - Colegio Colombiano de Neurociencias Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Asistente
    28 Nombre del evento: VII Simposio Nacional III Congreso Latinoamericano de Virología  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2017-11-30 00:00:00.0,  2017-12-02 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Centro Cultural Panamericana  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Nuevo método para la caracterización de extremos 5' y 3' del genoma de los cuatro serotipos del virus dengue Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Asociación Colombiana de Virología Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    • Nombre de la institución:INSTITUTO NACIONAL DE SALUD Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD COOPERATIVA DE COLOMBIA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Asistente , Compilador de memorias , Organizador , Ponente
    29 Nombre del evento: VIII Simposio Colombiano y VI Congreso Latinoamericano de Virología  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2019-10-03 00:00:00.0,  2019-10-05 00:00:00.0   en BOGOTÁ, D.C.   - Universidad El Bosque  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Caracterización molecular y fenotípica de cepas de virus dengue aisladas de pacientes con diferentes cuadros clínicos de la enfermedad en Colombia durante el periodo 2013-2016 Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    • Nombre del producto:Caracterización molecular y fenotípica de cepas de virus dengue aisladas de pacientes con diferentes cuadros clínicos de la enfermedad en Colombia durante el periodo 2013-2016 Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD EL BOSQUE Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Asistente , Ponente
    30 Nombre del evento: I Simposio de Enfermedades Infecciosas y Encuentro de la Red de Malaria 2017  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Nacional  Realizado el:2017-09-29 00:00:00.0,  2017-09-30 00:00:00.0   en SANTA MARTA   - Universidad Cooperativa de Colombia  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Patogénesis del dengue grave: evidencias in vitro e in vivo del papel del acervo genético viral. Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Conferencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD COOPERATIVA DE COLOMBIA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    • Nombre de la institución:INSTITUTO NACIONAL DE SALUD Tipo de vinculaciónGestionadora
    Participantes
    • Nombre: GABRIEL JAIME PARRA HENAO Rol en el evento: Organizador , Ponente magistral
    • Nombre: JOSE ALDEMAR USME CIRO Rol en el evento: Organizador , Ponente magistral

    Redes de conocimiento especializado

    Nombre de la red Red Colombiana de Virología  Tipo de redReal,  Creada el:2013-11-30 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   con participantes 
    Nombre de la red Asociación Colombiana de Virología  Tipo de redReal,  Creada el:2016-02-08 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   con participantes 

    Estrategias pedagógicas para el fomento a la CTI

    Nombre de la estrategia Firma del pacto de la lucha contra el mosquito  Inicio enOctubre - 2018,  Finalizó en :Octubre - 2018, 
    Nombre de la estrategia Semillero en Virología  Inicio enFebrero - 2017,  Finalizó en :Febrero - , 

    Artículos

  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, LUIS FERNANDO RESTREPO, ESPERANZA ROCIO TRUJILLO BRAVO, "Kappa-caseína bovina y su asociación con el recuento de células somáticas en ganado Holstein" . En: Colombia 
    Actualidades Biológicas  ISSN: 0304-3584  ed: Editorial Universidad de Antioquia
    v.26 fasc.80 p.17 - 22 ,2004,  DOI: 
    Palabras:
    CSN3, Análisis factorial, frecuencia alélica, frecuencia genotípica, Actividad antimicrobial, Leche,
    Sectores:
    Agricultura, pecuaria, silvicultura, explotación forestal - Producción animal, incluso servicios veterinarios,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, JAIRO ANDRES MENDEZ RICO, CRISTINA DOMINGO CARRASCO, ANTONIO TENORIO MATANZO, JUAN CARLOS GALLEGO GOMEZ, GLORIA JANNETH REY BENITO, "Simultaneous circulation of genotypes I and III of dengue virus 3 in Colombia" . En: Reino Unido 
    Virology Journal  ISSN: 1743-422X  ed: BioMed Central Ltd.
    v.5 fasc.101 p.1 - 28 ,2008,  DOI: 10.1186/1743-422X-5-101
    Palabras:
    Epidemiología Molecular, Genotipos, Vigilancia, Virus Dengue, Colombia,
    Sectores:
    Salud humana - Cuidado a la salud de las poblaciones humanas,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Revisión (Survey)
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, JAIME A LOPERA MADRID, JUAN CARLOS GALLEGO GOMEZ, "RNA Viruses as Experimental Models in Evolutionary Ecology" . En: Estados Unidos 
    En preparación  ISSN: 0  ed: 
    v.1 fasc.1 p.1 - 1 ,2009,  DOI: 
    Palabras:
    Evolución experimental, Teoría evolutiva, Ecología Viral,
    Sectores:
    Educación,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, ALBA MERY GOMEZ CASTANEDA, JUAN CARLOS GALLEGO GOMEZ, "Detección molecular y tipificación del virus dengue por RT-PCR y PCR anidada usando oligonucleótidos mejorados" . En: Colombia 
    Salud Uninorte  ISSN: 0120-5552  ed: Editorial Universidad del Norte
    v.28 fasc.1 p.1 - 15 ,2012,  DOI: 
    Palabras:
    Detección Molecular, Dengue, RT-PCR, Serotipificación,
    Sectores:
    Salud humana - Cuidado a la salud de las poblaciones humanas, Salud humana - Cuidado a la salud de las personas,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • KATHERINE DAYANNA LAITON DONATO, JOSE ALDEMAR USME CIRO, ANDRES PAEZ MARTINEZ, "Análisis filogenético del virus Chikungunya en Colombia: evidencia de selección purificadora sobre el gen E1" . En: Colombia 
    Biomedica  ISSN: 0120-4157  ed: Instituto Nacional de Salud
    v.36 fasc.Supl.1 p.1 - 34 ,2015,  DOI: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v36i0.2990
  • Producción bibliográfica - Artículo - Revisión (Survey)
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, KATHERINE DAYANNA LAITON DONATO, JAIRO ANDRES MENDEZ RICO, ANDRES PAEZ MARTINEZ, "The relevance of dengue virus genotypes surveillance at country level before vaccine approval" . En: Inglaterra 
    Human Vaccines '&' Immunotherapeutics  ISSN: 2164-5515  ed: Landes Bioscience
    v.10 fasc.9 p.1 - 5 ,2014,  DOI: 10.4161/hv.29563
    Palabras:
    Dengue, Neutralizing antibodies, Vaccines,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • JUAN DAVID PUERTA ARIAS, JOSE ALDEMAR USME CIRO, JUAN CARLOS GALLEGO GOMEZ, "Implementación de un control interno en la detección molecular de las principales especies de micoplasmas contaminantes de cultivos celulares" . En: Colombia 
    Salud Uninorte  ISSN: 0120-5552  ed: Editorial Universidad del Norte
    v.29 fasc.02 p.160 - 173 ,2013,  DOI: 
    Palabras:
    Detección Molecular, PCR, Control interno, Micoplasma,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • JAIME A LOPERA MADRID, LUIS ENJUANES, FERNANDO ALMAZAN, JOSE ALDEMAR USME CIRO, JUAN CARLOS GALLEGO GOMEZ, "Development of a novel DNA-launched dengue virus type 2 infectious clone assembled in a bacterial artificial chromosome" . En: Inglaterra 
    Virus Research  ISSN: 0168-1702  ed: Elsevier Science Bv
    v.180 fasc.N/A p.12 - 22 ,2014,  DOI: 10.1016/j.virusres.2013.12.001
    Palabras:
    infectious cDNA, Dengue, reverse genetics,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Revisión (Survey)
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, NATALIA CAMPILLO PEDROZA, FERNANDO ALMAZAN, JUAN CARLOS GALLEGO GOMEZ, "Cytoplasmic RNA viruses as potential vehicles for the delivery of therapeutic small RNAs" . En: Inglaterra 
    Virology Journal  ISSN: 1743-422X  ed: BioMed Central Ltd.
    v.10 fasc.185 p.1 - 10 ,2013,  DOI: 10.1186/1743-422X-10-185
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • JAIRO ANDRES MENDEZ RICO, JOSE ALDEMAR USME CIRO, CRISTINA DOMINGO CARRASCO, GLORIA JANNETH REY BENITO, JUAN A. SANCHEZ, ANTONIO TENORIO MATANZO, JUAN CARLOS GALLEGO GOMEZ, JUAN ARMANDO SANCHEZ MUNOZ, "Phylogenetic reconstruction of dengue virus type 2 in Colombia" . En: Inglaterra 
    Virology Journal  ISSN: 1743-422X  ed: BioMed Central Ltd.
    v.9 fasc.64 p.1 - 11 ,2012,  DOI: 10.1186/1743-422X-9-64
    Palabras:
    Virus Dengue, Phylogenetic,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • JAIRO ANDRES MENDEZ RICO, JOSE ALDEMAR USME CIRO, CRISTINA DOMINGO CARRASCO, GLORIA JANNETH REY BENITO, JUAN A. SANCHEZ, ANTONIO TENORIO MATANZO, JUAN CARLOS GALLEGO GOMEZ, "Phylogenetic history demonstrates two different lineages of dengue type 1 virus in Colombia" . En: Reino Unido 
    Virology Journal  ISSN: 1743-422X  ed: BioMed Central Ltd.
    v.7 fasc.N/A p.1 - 12 ,2010,  DOI: 10.1186/1743-422X-7-226
    Palabras:
    Epidemiología Molecular, Colombia, flavivirus, Virus Dengue,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, FERNANDO ALMAZAN, DIEGO ALEJANDRO ALVAREZ DIAZ, LUIS ENJUANES, JAIME A LOPERA MADRID, "Generation of a DNA-Launched Reporter Replicon Based on Dengue Virus Type 2 as a Multipurpose Platform" . En: Suiza 
    Intervirology  ISSN: 0300-5526  ed: Germering Karger
    v.59 fasc.5-6 p.275 - 282 ,2016,  DOI: 10.1159/000476066
    Palabras:
    Dengue virus, Flavivirus, Replicon, Bacterial artificial chromosome, reverse genetics,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, ANDREA ELIZABETH PAREDES MEDINA, ERICA NATALIA TOLOSA PEREZ, ANDRES PAEZ MARTINEZ, KATHERINE DAYANNA LAITON DONATO, "Detection and Molecular Characterization of Zoonotic Poxviruses Circulating in the Amazon Region of Colombia, 2014" . En: Estados Unidos 
    Emerging Infectious Diseases  ISSN: 1080-6059  ed: Centers for Disease Control and Prevention (CDC)
    v.23 fasc.4 p.649 - 653 ,2017,  DOI: http://dx.doi.org/10.3201/eid2304.161041
    Palabras:
    Detección Molecular, PCR, poxvirus,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, "Evolution in spatially mixed host environments increases divergence for evolved fitness and intrapopulation genetic diversity in RNA viruses" . En: Inglaterra 
    Virus Research  ISSN: 1872-7492  ed: Elsevier Science Bv
    v.2 fasc.1 p.1 - 8 ,2016,  DOI: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v36i0.2990
    Palabras:
    Ecología Viral, Teoría evolutiva,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • ERICA NATALIA TOLOSA PEREZ, NORMA CONSTANZA CUELLAR ESPITIA, OSCAR EDUARDO PACHECO GARCIA, MARTHA PATRICIA ESCALANTE MORA, JOSE ALDEMAR USME CIRO, DIOSELINA PELAEZ CARVAJAL, "Estudio de conglomerado de casos de hepatitis B en el Establecimiento Penitenciario de Mediana y Alta Seguridad (EPMAS) Doña Juana, municipio La Dorada (Caldas), año 2014" . En: Colombia 
    Informe Quincenal - Epidemiológico Nacional  ISSN: 0122-9907  ed: Instituto Nacional de Salud
    v.21 fasc.6 p.216 - 237 ,2016,  DOI: 
    Palabras:
    infección viral, Virus de hepatitis B,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, ALICIA ALEJANDRA ROSALES MUNAR, DIEGO ALEJANDRO ALVAREZ DIAZ, KATHERINE DAYANNA LAITON DONATO, DIOSELINA PELAEZ CARVAJAL, "Efficient Method for Molecular Characterization of the 5¿ and 3¿ Ends of the Dengue Virus Genome" . En: Suiza 
    Viruses  ISSN: 1999-4915  ed: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
    v.12 fasc.496 p.1 - 10 ,2020,  DOI: 10.3390/v12050496
    Palabras:
    RACE-PCR, Dengue virus, Detección Molecular,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, KATHERINE DAYANNA LAITON DONATO, ANDRES PAEZ MARTINEZ, "Progressive Vaccinia Acquired through Zoonotic Transmission in a Patient with HIV/AIDS, Colombia" . En: Estados Unidos 
    Emerging Infectious Diseases  ISSN: 1080-6059  ed: Centers for Disease Control and Prevention (CDC)
    v.26 fasc.3 p.601 - 605 ,2020,  DOI: 10.3201/eid2603.191365
    Palabras:
    Zoonosis, Detección Molecular, Vaccinia virus,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • DIEGO ALEJANDRO ALVAREZ DIAZ, CARLOS ESTEBAN FRANCO MUNOZ, KATHERINE DAYANNA LAITON DONATO, JOSE ALDEMAR USME CIRO, MARCELA MARIA MERCADO REYES, "Molecular analysis of several in-house rRT-PCR protocols for SARS-CoV-2 detection in the context of genetic variability of the virus in Colombia" . En: Países Bajos 
    Infection, Genetics and Evolution  ISSN: 1567-1348  ed: Elsevier Science Bv
    v.84 fasc.104390 p.1 - 7 ,2020,  DOI: 10.1016/j.meegid.2020.104390
    Palabras:
    Molecular diagnostics, SARS-CoV-2,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, "Seroprevalence and Risk Factors Possibly Associated with Emerging Zoonotic Vaccinia Virus in a Farming Community, Colombia" . En: Estados Unidos 
    Emerging Infectious Diseases  ISSN: 1080-6059  ed: Centers for Disease Control and Prevention (CDC)
    v.25 fasc.12 p.2169 - 2176 ,2019,  DOI: 10.3201/eid2512.181114
    Palabras:
    Emerging, Epidemiology, poxvirus,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • DIEGO ALEJANDRO ALVAREZ DIAZ, PAULA QUINTERO CORTES, DIOSELINA PELAEZ CARVAJAL, NADIM AJAMI PERALTA, JOSE ALDEMAR USME CIRO, "Novel pan-serotype control RNA for dengue virus typing through real-time reverse transcription-polymerase chain reaction" . En: Países Bajos 
    Journal of Virological Methods  ISSN: 0166-0934  ed: Elsevier Science Bv
    v.271 fasc.113677 p.1 - 6 ,2019,  DOI: 10.1016/j.jviromet.2019.113677
    Palabras:
    Serotipificación, RT-PCR, Dengue virus,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Revisión (Survey)
  • ANDRES PAEZ MARTINEZ, KATHERINE DAYANNA LAITON DONATO, JOSE ALDEMAR USME CIRO, "Vaccinia zoonótica en Colombia: evidencia acumulativa de la emergencia de los poxvirus en el mundo" . En: Colombia 
    Revista de Salud Pública  ISSN: 2539-3596  ed: 
    v.20 fasc.6 p.778 - 783 ,2018,  DOI: 10.15446/rsap.v20n6.67962
    Palabras:
    poxvirus, Epidemiología Molecular,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • KATHERINE DAYANNA LAITON DONATO, DIEGO ALEJANDRO ALVAREZ DIAZ, AURA CATERINE RENGIFO CASTILLO, ORLANDO TORRES FERNANDEZ, JOSE ALDEMAR USME CIRO, JORGE ALONSO RIVERA RIVERA, ANGELICA MARIA RICO TURCA, LISSETHE CAROLINA PARDO HERRERA, DIOSELINA PELAEZ CARVAJAL, "Complete genome sequence of a Colombian Zika Virus isolated from BALB/c mouse brain after intraperitoneal inoculation" . En: Estados Unidos 
    Microbiology Resource Announcements  ISSN: 2576-098X  ed: American Society for Microbiology
    v.8 fasc.46 p.1 - 3 ,2019,  DOI: 10.1128/MRA.01719-18
    Palabras:
    Genome, Zika virus, Patogénesis,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • KATHERINE DAYANNA LAITON DONATO, DIEGO ALEJANDRO ALVAREZ DIAZ, DIOSELINA PELAEZ CARVAJAL, MARCELA MARIA MERCADO REYES, NADIM AJAMI PERALTA, IRENE BLUMENFELD BOSCH, JOSE ALDEMAR USME CIRO, "Molecular characterization of dengue virus reveals regional diversification of serotype 2 in Colombia" . En: Reino Unido 
    Virology Journal  ISSN: 1743-422X  ed: BioMed Central Ltd.
    v.16 fasc.62 p.1 - 7 ,2019,  DOI: 10.1186/s12985-019-1170-4
    Palabras:
    Envelope, Dengue virus, Phylogenetic,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • DIOSELINA PELAEZ CARVAJAL, NIDIA JANETH FORERO CASTRO, MARTHA PATRICIA ESCALANTE MORA, KATHERINE DAYANNA LAITON DONATO, JOSE ALDEMAR USME CIRO, "Variabilidad genética en regiones codificantes del antígeno de superficie y dominio transcriptasa inversa de la polimerasa del virus de la hepatitis B, Colombia, 2002-2014." . En: Colombia 
    Biomedica  ISSN: 0120-4157  ed: Instituto Nacional de Salud
    v.38 fasc.Sp. 2 p.XX - XX ,2018,  DOI: 10.7705/biomedica.v38i3.3871
    Palabras:
    Virus de hepatitis B, Mutación, Genotipos, Transcriptasa reversa,

    Capitulos de libro

  • Tipo: Otro capítulo de libro publicado
    JOSE ALDEMAR USME CIRO, Tipo: Otro capítulo de libro publicado
    RICHARD HOYOS LOPEZ, Tipo: Otro capítulo de libro publicado
    JUAN CARLOS GALLEGO GOMEZ, "Viral Evolutionary Ecology: Conceptual Basis of a New Scientific Approach for Understanding Viral Emergence" Epidemiology- Current Perspectives On Research And Practice . En: Croacia  ISBN: 978-953-51-0382-0  ed:  , v. , p.119 - 130  ,2012
    Areas:
    Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Virología,
  • Tipo: Otro capítulo de libro publicado
    JOSE ALDEMAR USME CIRO, "Evolución viral: las bases moleculares de la eficacia biológica" Evolución: El Legado de Darwin . En: Colombia  ISBN: 978-958-714-785-8  ed: Editorial Universidad de Antioquia , v. , p.27 - 52  ,2018
    Palabras:
    Ecología Viral, Evolución experimental, Teoría evolutiva, Quasispecies,
    Areas:
    Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología (Teórica, Matemática, Criobiología, Evolutiva),
    Sectores:
    Educación - Educación superior,
  • Innovación de proceso o procedimiento

  • Producción técnica - Innovación de proceso o procedimiento
  • JUAN CARLOS GALLEGO GOMEZ, JOSE ALDEMAR USME CIRO, DIEGO ALEJANDRO ALVAREZ DIAZ, ELIZABETH OROZCO GARCIA, LINETH VANESSA VALENCIA PELAEZ, Producción de un kit para diagnosticar contaminación por Mycoplasma, Nombre comercial: , contrato/registro: , . En: Colombia,  ,2013, 
    Areas:
    Ciencias Médicas y de la Salud -- Biotecnología en Salud -- Biotecnología Relacionada con la Salud,

    Normas y Regulaciones

  • Producción técnica - Regulación, norma, reglamento o legislación - Ambiental o de Salud
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, Plan Nacional de Control de las Hepatitis Virales, Nombre comercial: , contrato/registro: , . En: Colombia,  ,2014,  .ed:   meses   p.  .regulación:   .tipo:  

    Informes de investigación

  • Producción técnica - Informes de investigación
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, JUAN CARLOS GALLEGO GOMEZ, FERNANDO ALMAZAN, LUIS ENJUANES, Informe final de proyecto Implementación de un vector basado en Virus Dengue para la liberación de RNAi terapéuticos en enfermedades Neurodegenerativas . En: ,  ,2013, 
  • Producción técnica - Informes de investigación
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, JUAN CARLOS GALLEGO GOMEZ, SANDRA GONI, ADRIAN DIAZ, Informe final de proyecto Desarrollo de herramientas para el estudio de la biología molecular del virus de la encefalitis de Saint Louis (SLEV) . En: ,  ,2014, 
  • Producción técnica - Informes de investigación
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, JUAN CARLOS GALLEGO GOMEZ, GLORIA JANNETH REY BENITO, JAIRO ANDRES MENDEZ RICO, ANTONIO TENORIO MATANZO, CRISTINA DOMINGO CARRASCO, Informe final de proyecto Epidemiología Molecular del Virus Dengue en Colombia 1977-2004 y Vigilancia de Genotipos Circulantes 2005-2006 . En: ,  ,2007, 

    Demás trabajos

  • Demás trabajos - Demás trabajos
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, Virus selváticos: emergencia y futuras epidemias . En: Colombia,  ,2017,  finalidad: Presentar la problemática de la emergencia de enfermedades virales a partir de sus ciclos selváticos y sensibilizar sobre el contexto ecológico en muchas regiones del país que favorecerían el contacto y por ende futuras epidemias. Ver link: http://www.ucc.edu.co/prensa/2016/Paginas/virus-selvaticos 
    Areas:
    Ciencias Médicas y de la Salud -- Ciencias de la Salud -- Salud Pública, Ciencias Médicas y de la Salud -- Ciencias de la Salud -- Medicina Tropical,
    Sectores:
    Salud humana - Cuidado a la salud de las personas, Salud humana - Cuidado a la salud de las poblaciones humanas,
  • Demás trabajos - Demás trabajos
  • JOSE ALDEMAR USME CIRO, Día Mundial de la Hepatitis: reafirmando nuestro compromiso con la salud pública . En: Colombia,  ,2019,  finalidad: Artículo divulgativo en sala del conocimiento para mostrar la importancia de las hepatitis virales y los esfuerzos que desde diferentes instituciones se realizan en el marco de la celebración del día mundial de las hepatitis 

    Proyectos

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Implementación de un vector basado en Virus Dengue para la liberación de RNAi terapéuticos en enfermedades Neurodegenerativas
    Inicio: Noviembre  2008 Fin proyectado: Noviembre  2011 Fin: Noviembre  2011 Duración 36
    Resumen

    El uso de vectores virales se ha constituido en la mejor herramienta para la liberación de genes terapéuticos y los mismos están ahora siendo utilizados in vivo en la liberación de RNAi para el tratamiento de muchas enfermedades. Los vectores virales disponibles para terapia génica poseen limitaciones para ser usados con seguridad en el tratamiento de enfermedades en humanos, debido entre otros factores a su inmunogenicidad, integración al genoma y potencial oncogénico, además de la baja especificidad a nivel celular y tiempo de expresión del transgen de interés; haciendo necesario el diseño de nuevos vectores que permitan superar dichos problemas. El Virus Dengue es un Flavivirus ampliamente distribuido, del cual se han obtenido cDNAs infecciosos a través de la clonación en plásmidos convencionales, de bajo número de copias, cromosomas artificiales de levadura y de bacteria. Este virus posee características útiles para su uso en terapia génica, como son, la demostrada actividad replicativa en el núcleo sin integrarse al genoma del hospedero, la potente inhibición de la respuesta IFN, su potencial neurotropismo, estructuras 5¿- y 3¿-UTR que recrean un ambiente de microRNA, así como un genoma de tamaño pequeño que permite su fácil manipulación. El presente proyecto busca la construcción de un cDNA infeccioso en cromosoma artificial bacteriano, bajo el control del promotor CMV, así como la obtención de un vector viral bioseguro basado en Virus Dengue, cuya evaluación in vitro e in vivo permitirá determinar su habilidad para invadir el sistema nervioso central, así como para transducir poblaciones neuronales diferencialmente. Finalmente la clonación de secuencias de RNAi contra Cdk5 y su evaluación en cultivos primarios de ratón, permitirá postularlo como una alternativa terapéutica para el tratamiento de enfermedades neurodegenerativas, específicamente la enfermedad de Alzheimer.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Rastreo de virus emergentes y re-emergentes en mosquitos silvestres de zonas de la costa atlántica Colombiana
    Inicio: Enero  2010 Fin proyectado: Enero  2013 Fin: Junio  2013 Duración 36
    Resumen

    En las últimas décadas, diversos factores han llevado al aumento en la incidencia de enfermedades infecciosas, siendo de mayor impacto la intervención de ecosistemas naturales, con la consecuente emergencia y re-emergencia entre otras, de enfermedades virales. Diversos virus se mantienen indefinidamente en ciclos de transmisión natural que incluyen especies silvestres de artrópodos y vertebrados. La alteración de dichos ciclos es favorecida por la intervención humana y el salto de especies y por ende colonización de un nuevo hospedero se convierte en un riesgo para la salud. En Colombia, la ocurrencia de brotes epidémicos que cobran vidas y cuyos agentes etiológicos son algunas veces desconocidos o mal identificados, han causado alerta general y son evidencia de que el país no está preparado para su prevención y mucho menos su control. Aunque existen pocos estudios recientes, históricamente se ha demostrado la presencia de muchos arbovirus a nivel selvático que podrían ser transmitidos al humano, por lo cual su identificación y exhaustivo análisis virológico y entomológico serán decisivos en la prevención, además de aportar información básica valiosa acerca de la ecología viral.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Caracterización de Aislados Clínicos del Virus del Dengue en Antioquia con Énfasis en su Potencial Hemorrágico
    Inicio: Enero  2004 Duración 
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Epidemiología Molecular del Virus Dengue en Colombia 1977-2004 y Vigilancia de Genotipos Circulantes 2005-2006
    Inicio: Enero  2005 Fin: Enero  2008 Duración 
    Resumen

    El Dengue es la virosis más frecuente y endémica en Colombia [26,27,28,37], y otros países tropicales y subtropicales en desarrollo, con una repercusión socioeconómica muy grande [20,21,30,39], pero sin mucha atención por parte de los gobiernos enmarcándose dentro de las ¿Enfermedades Descuidadas¿ [11,40,47]. En Colombia aunque existen muy pocos grupos de investigación en Dengue, los fondos nacionales concedidos no son concordantes con la realidad epidemiológica del problema. Las frecuencias del Dengue Clásico (DF), Dengue Hemorrágico (DHF) y Síndrome del Choque por Dengue (DSS) aumentaron drásticamente en los últimos años, tanto en Colombia como en otros países de Latinoamérica, Asia y África [20,21], considerándose al Dengue una Enfermedad Viral Emergente con todo lo que ello implica [39,35]. Por la carencia de recursos económicos y una masa crítica de investigadores, sólo contamos con dos estudios nacionales [37, 38] sobre epidemiología molecular del Virus Dengue (DV). Este proyecto nos capacitará para mejorar la vigilancia por el laboratorio y fortalecer el control y vigilancia epidemiológicas, que ha hecho el Instituto Nacional de Salud (INS) durante muchos años, y aprovechando esta valiosa experiencia, haremos alianzas estratégicas para la investigación y transferencia de tecnología, desde el grupo del Instituto de Salud Carlos III (IS CIII) (Majadahonda, Madrid, España) hacia el INS y el Grupo de Inmunovirología de la UdeA. El INS será el depositario de las nuevas metodologías, para transferirlas a los demás Laboratorios Departamentales de Referencia a nivel nacional, y hacia otros grupos de investigación en dengue, lo cual tendrá impacto en la comunidad científica regional, nacional y sociedad en general. Para la vigilancia del DV es importante estudiar los serotipos circulantes, y cómo la introducción de una nueva variante reemplaza la preexistente, aumentando el riesgo para ocurrencia de DHF/DSS [22]. Evaluar la variación genética intraserotípica, per

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Papel del Citoesqueleto en la Infección por el Virus Dengue
    Inicio: Enero  2005 Fin proyectado: Enero  2007 Fin: Enero  2007 Duración 24
    Resumen

    El Virus Dengue es uno de los más endémicos en regiones tropicales y subtropicales de todo el mundo, afecta unos 2 mil millones de personas al año, y causa grandes pérdidas económicas en países en desarrollo. En los últimos años ha incrementado drásticamente su incidencia, considerándose actualmente una Enfermedad Viral Emergente. Del mismo modo, los casos de Dengue Hemorrágico (DH) han aumentado en todos países afectados, y es la primera enfermedad viral de Colombia con unos 50 mil casos al año, de los cuales 10% son hemorrágicos. Existen varias teorías para explicar la aparición de más casos de DH, unas apuntan a un fenómeno de autoinmunidad (ADE, Antibody dependent enhancement), otras a variantes genéticas más virulentas por mutación y/o recombinación de genotipos circulantes, y finalmente, el factor precipitante es el socioeconómico, pues es una enfermedad de países pobres, donde hay malos sistemas de salud, las personas viven en hacinamiento con malas condiciones de higiene y planes de urbanización precarios; el dengue puede ser pues postulado como un marcador del subdesarrollo. Se pretende con esta investigación encontrar, las alteraciones que sufre el citoesqueleto o algún otro marcador celular (Golgi o retículo endoplásmico rugoso), pues se sabe que el DH ocurre en las infecciones secundarios con otro serotipo, que parece deberse a una entrada facilitada de Virus Dengue a las células blanco, y por un aumento en las tasas de replicación viral intracelular. Este proyecto apunta a la íntima relación virus-célula hospedera, para identificar en la biología celular de la infección viral lo que puede estar provocando, que la infección secundaria sea más virulenta, efectiva y cause la tormenta de citoquinas (interferon, interleuquinas, factor de necrosis tumoral, factor de crecimiento tumoral, proteínas del complemento, y otros), que explican los hallazgos del dengue hemorrágico y síndrome de choque por dengue, caracterizados por un aumento de la permeabilidad va

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Evaluación del Potencial Terapéutico de Inhibidores de la Isoprenilación de las Rho GTPasas en Cultivos Infectados con el Virus Dengue
    Inicio: Enero  2006 Fin proyectado: Enero  2009 Fin: Agosto  2009 Duración 36
    Resumen

    El Dengue constituye una de las enfermedades virales más importantes en los países en desarrollo (2.500 millones de personas en riesgo de infección). En Colombia se presentan anualmente cerca de 50000 casos (10% de Dengue Hemorrágico), convirtiéndola en una enfermedad con gran impacto económico, incluso podría postularse como un indicador de subdesarrollo. Con la emergencia de la ¿Biología Celular de la Infección Viral¿, la interacción virus-célula hospedera se concibe de forma distinta a la tradicional, por lo que nuestro principal objetivo es adelantar estudios que permitan comprender cómo se están relacionando elementos celulares, tales como el citoesqueleto y proteínas de señalización celular, con el Virus Dengue (DV). Se ha demostrado que las infecciones virales causan cambios en la morfología celular, debido a reorganización del citoesqueleto mediante la activación de la vía de señalización de las Rho GTPasas (Rac1, RhoA y Cdc42). Estas proteínas actúan en muchos procesos celulares, por lo que se han relacionado con enfermedades como el asma y lesiones pulmonares, donde median el desmantelamiento del citoesqueleto, lo que produce edemas pulmonares debido al aumento en la permeabilidad celular. Acerca del DV, se ha postulado que cambios en el citoesqueleto podrían explicar el cuadro clínico del Dengue Hemorrágico, pero no se han realizado estudios que exploren el papel del citoesqueleto en la infección viral, y las Rho GTPasas como efectores del citoesqueleto. Trabajos en nuestro laboratorio han demostrado que la infección con el DV en cultivos celulares, produce reorganización en el citoesqueleto. Lo anterior hace necesario el desarrollo de estudios básicos que profundicen en los eventos celulares involucrados durante la infección con el DV, permitiendo la búsqueda de terapias para la infección con DV. En este sentido, las estatinas son drogas utilizadas para tratamientos de la hipercolesterolemia, pero que a su vez inactivan las Rho GTPasas por inhibició

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Búsqueda de Asociación entre los Genotipos de kappa-Caseína y la Resistencia/Susceptibilidad a Mastitis Bovina
    Inicio: Enero  2001 Duración 
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Development of RNAi as Treatment for Neurodegeneration
    Inicio: Enero  2007 Fin: Enero  2010 Duración 
    Resumen

    Alzheimer¿s disease, already a serious global disease afflicting large segments of the population, is about to burgeon into an even larger problem as the baby-boomer bubble approaches retirement age. The disease remains incurable; however validated therapeutic targets are known. RNA interference (RNAi) technology poses a potential therapeutic option which requires further investigation. Targeting the mRNA rather than the protein offers major advantages in the ease of designing a highly specific inhibitory agent and rapidly advancing approaches to RNAi delivery suggest that the method can be developed into a therapy. Our hypothesis is that RNAi will prove to be an effective and selective strategy to slow, and perhaps even reverse, the pathogenic processes in inherited and sporadic AD. This proposal follows the completion of an R21 award of the same title. The announcement for this award was an RFA from the Fogarty Institute for proposals related to Brain Disorders in the Developing World and a major goal of the program was to build research capacity at the foreign site. The successful completion of the R21 aims is described in the preliminary data. The collaborative effort poses two questions concerning the cause and possible treatment of neurofibrillary pathology in AD. One question is whether suppression of Cdk5, an increasingly accepted disease target, can modify neurofibrillary pathology in an animal model. Cdk5 is an enzyme that phosphorylates tau protein and in so doing is thought to contribute to the conversion of the protein into an insoluble aggregate known as the neurofibrillary tangle. Cdk5 will be targeted by RNAi delivered in a viral vector. The second question is whether BACE1 inhibition by RNAi delivery can retard or prevent the development of neurofibrillary pathology in an animal with both plaques and tangles. The studies proposed here are intended to continue building research capacity at the foreign site which is now in a position to launch t

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Estudio filogeográfico de virus emergentes y re-emergentes circulantes en la frontera nororiental colombo-venezolana
    Inicio: Enero  2017 Fin: Diciembre  2019 Duración 
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    EXPEDICIÓN VIROLÓGICA EN ECOSISTEMAS REPRESENTATIVOS DE COLOMBIA: SELVA HÚMEDA TROPICAL DE LA SIERRA NEVADA DE SANTA MARTA
    Inicio: Enero  2018 Duración 
    Resumen

    Introducción: Colombia ha sido catalogada como un país megadiverso por su inmensa variedad de ecosistemas y especies biológicas de vertebrados e invertebrados. La coincidencia de esta biodiversidad tropical con los crecientes reportes de enfermedades infecciosas de origen desconocido, sugieren que nuestro país podría también ser rico en virus que hasta la fecha han pasado inadvertidos para las actuales capacidades de diagnóstico y vigilancia epidemiológica. El surgimiento de nuevas tecnologías como la secuenciación de última generación ha permitido reconocer la enorme ¿virodiversidad¿ que acompaña a las diferentes especies biológicas y que podrían ir avanzando en los peldaños del proceso de emergencia hacia la población humana. Objetivo: Describir la virodiversidad presente en mosquitos (Diptera: Culicidae) de la selva húmeda tropical de Colombia y su potencial impacto en salud pública, a través de la secuenciación profunda, métodos virológicos y computacionales. Metodología: Se colectarán mosquitos (Diptera: Culicidae) hematófagos de la selva húmeda tropical de las estribaciones de la vertiente noroccidental de la Sierra Nevada de Santa Marta, garantizando el cubrimiento de la variabilidad estacional. El material entomológico será utilizado para la identificación taxonómica y almacenado en condiciones adecuadas para la preservación y posterior extracción de ARN total a partir de lisados de tejidos, y la secuenciación mediante la plataforma Illumina o equivalente. Mediante métodos computacionales se realizará el filtrado de lecturas correspondientes al genoma de las especies de mosquitos y las lecturas restantes serán analizadas para la identificación de genomas de virus previamente descritos y otros genomas que por su estructura puedan corresponder a nuevas especies de virus. La información resultante será utilizada como materia prima para el desarrollo de nuevos métodos moleculares para la detección y el ajuste de los métodos disponibles en el caso de virus previamente reportados. Resultados esperados: Se espera avanzar en el reconocimiento de la virodiversidad presente en las selvas colombianas y en el conocimiento de las principales especies de mosquitos potenciales vectores de dichos virus, información crítica para establecer dinámicas de transmisión y para determinar el potencial riesgo de emergencia de virus silvestres hacia la población humana, un esfuerzo anticipación y preparación frente a futuros brotes y epidemias.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Prevalencia y Modelación de la infección por Virus de la Hepatitis C en Colombia
    Inicio: Diciembre  2017 Duración 
    Resumen

    La Asamblea Mundial de la Salud seleccionó la pandemia por Virus de las Hepatitis como una prioridad teniendo en cuenta el peso epidemiológico en términos de morbilidad, mortalidad, años de vida perdidos, años de vida con discapacidad y el costo para el sistema de salud. En el caso de la infección por VHC se estiman de 150 a 170 millones de casos a nivel global y cerca de 700.000 muertes al año asociadas a la infección por este virus. Esta infección evoluciona a un cuadro crónico en 60 a 80% de los pacientes, con riesgo de hepatopatías terminales como cirrosis hepática y carcinoma hepatocelular. En Colombia la notificación de casos en el 2016 no superó la cifra de 300 pacientes en todo el territorio nacional. De tal manera el peso epidemiológico de la enfermedad en el país es imposible de calcular dado el evidente subregistro de casos y la información incompleta y fragmentada en grupos de riesgo. La presente propuesta de investigación permitirá establecer la prevalencia de infección por VHC en población con antecedente transfusional antes de 1996, principal factor de riesgo en Colombia, en las dos ciudades más importantes del país, una ciudad de la costa atlántica y una ciudad del eje cafetero. Se realizará una búsqueda de individuos con antecedente transfusional en empresas y mediante publicidad en redes sociales y la radio. Se realizarán charlas de prevención de la infección en la población de estudio. El tamaño de muestra fue calculado según los resultados de previos estudios en esta población y teniendo en cuenta el número de personas transfundidas y la población total de cada una de las 4 ciudades. Los resultados del estudio serán de gran importancia para estimar la prevalencia de la infección y la carga de la hepatitis C en el país, además de identificar los individuos candidatos a tratamiento antiviral. Adicionalmente se conocerá la distribución de genotipos virales en la población de estudio y se estimará la dinámica e introducción de los genotipos y subgenotipos de VHC en Colombia. Esta información será de gran importancia para el Ministerio de Salud y Protección Social, la Organización Panamericana de la Salud, la comunidad académica y científica, las Empresas Prestadoras de Salud y la población colombiana.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Variabilidad genética y Morfológica de Aedes aegypti en dos zonas endémicas de dengue en Colombia
    Inicio: Octubre  2015 Duración 
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Estudio histopatológico y molecular de casos fatales por dengue y sus posibles asociaciones con el tropismo viral
    Inicio: Agosto  2016 Duración 
    Resumen

    Introducción: Con una distribución global comparable a la malaria, el dengue se ha constituido como una de las enfermedades transmitidas por vectores que más afecta a los seres humanos en el mundo. En los países latinoamericanos, Colombia es históricamente uno de los más afectados con epidemias del dengue, de hecho durante los años pasados la letalidad ha incrementado del 2,2% en el 2010 a 6,3 en el 2014. Actualmente el tratamiento de la enfermedad es paliativo debido al desconocimiento del complejo inter-juego entre factores virales, genética y respuesta inmune del hospedero, factores que están involucrados en el desarrollo del espectro clínico que va desde un estado asintomático de la infección a manifestaciones hemorrágicas, permeabilidad vascular y falla multiorgánica. El escaso conocimiento sobre la patogénesis del dengue se puede atribuir a que la enfermedad afecta principalmente los países menos desarrollados o con altos niveles de pobreza. Otro factor importante es la falta de un modelo animal que desarrolle el espectro completo de signos clínicos de la infección lo que entre otros disminuye la posibilidad en la generación de vacunas y tratamientos eficaces para la prevención y tratamiento de la enfermedad. El sub-registro sobre los signos y síntomas de casos probables de dengue, la falta de caracterización de los serotipos de la infección así como los pocos estudios minuciosos en necropsias de pacientes post mortem son otras condiciones que han retardado los avances en el conocimiento de la patogénesis de la enfermedad. Estas descripciones resultarían de mucho valor al ampliar el conocimiento de las interacciones complejas entre factores de virulencia, respuesta inmune y genética del hospedero en el curso de la enfermedad. Objetivo General: Caracterizar las manifestaciones clínicas e histopatológicas en casos fatales por dengue y sus posibles asociaciones con el tropismo de los tipos virales. Metodología: Se trabajará con muestras de pacientes fallecidos por la infección viral durante el año 2010 en Colombia. Se seleccionarán muestras de tejido embebidos en parafina de distintos órganos como hígado, corazón, pulmón, riñón, y bazo entre otros. En estas muestras se llevarán a cabo estudios histopatológicos y ensayos inmunohistoquímicos para detección de antígenos virales del dengue y adicionalmente se realizaran ensayos moleculares de serotipificación y genotipificación viral del dengue. Como controles positivos se usaran cerebros de ratones inoculados por vía intracerebral con cada uno de los serotipos virales. Los resultados obtenidos se expresarán en términos cualitativos y cuantitativos para integrar los hallazgos histopatológicos y moleculares de la infección viral. Resultados esperados: Contribuir en el conocimiento de la patogénesis de la infección por dengue al establecer las probables relaciones entre las cepas infectantes, aspectos clínicos de la infección, y el tropismo de los tipos virales en el hospedero humano.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Aproximación interdisciplinar al estudio de la dinámica de los arbovirus en la vertiente noroccidental de la Sierra Nevada de Santa Marta, Colombia
    Inicio: Enero  2017 Duración 
    Resumen

    Fase previa: Las arbovirosis, enfermedades causadas por virus transmitidos por vectores artrópodos, son un problema recurrente y cada vez mayor en Colombia. Además de los virus que han sido importados para hacer parte de ciclos de transmisión urbana, durante los últimos 50 años, se ha evidenciado la presencia de múltiples arbovirus en ciclos selváticos, los cuales, en algunos casos han hecho incursiones en la población humana como hospedero final, sin que logre establecerse una nueva extensión de su ciclo en zonas urbanas. Escenarios de múltiples contrastes en el grado de intervención y presencia del humano, existen en las estribaciones de la Sierra Nevada de Santa Marta, departamento del Magdalena, los cuales podrían favorecer el establecimiento de nuevas dinámicas de enfermedad. Propuesta de continuidad: Mediante la propuesta se pretende identificar los arbovirus circulantes en la vertiente noroccidental de la Sierra Nevada de Santa Marta y las especies de mosquitos involucradas en su transmisión en área urbana, periurbana, rural y silvestre. Para ello se realizará la captura de mosquitos en cuatro zonas definidas de acuerdo al grado de perturbación y densidad de población humana. Los mosquitos serán identificados hasta el nivel de género o especie y pooles de 13 individuos serán posteriormente almacenados en RNAlater®. La extracción del RNA viral se realizará mediante el estuche RNeasy® y los RNAs serán utilizados en la amplificación por RT-PCR por medio de oligonucleótidos genéricos. Las muestras que resulten positivas serán secuenciadas, y de acuerdo a la especie de virus identificada, se realizarán diseños de nuevos oligonucleótidos para la amplificación y secuenciación de genes específicos. Las secuencias obtenidas se utilizarán en el análisis filogenético. La información obtenida a nivel virológico y entomológico, será analizada con el fin de aportar conocimiento sobre la dinámica de estos virus en la zona de estudio. Resultados esperados: Al finalizar el estudio, se tendrá una caracterización de las especies de arbovirus presentes en las zonas de muestreo y las especies de mosquitos que potencialmente participan en sus ciclos de transmisión. Esta información será crítica para el reconocimiento de posibles ciclos naturales de transmisión de arbovirus en la región y el potencial riesgo para la población humana.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Análisis de determinantes genéticos de virulencia en cepas del virus dengue tipo 2
    Inicio: Octubre  2014 Fin: Octubre  2016 Duración 
    Resumen

    El virus del dengue (DENV) es el causante del dengue, una de las enfermedades más importantes transmitidas por vector según la Organización Mundial de la Salud (OMS). En los 5 últimos años, en Colombia se han reportado entre 33.000 y 157.000 casos de dengue anualmente y se estima que casi 24 millones de personas son susceptibles a la infección. Aunque el principal factor asociado a la severidad es la ocurrencia de infecciones secundarias por serotipos heterólogos llevando a una potenciación dependiente de anticuerpos, un número creciente de estudios sugiere la existencia de determinantes genéticos de virulencia en diferentes regiones del genoma viral, que pueden llevar al desarrollo de los diferentes cuadros clínicos de la enfermedad. El objetivo de esta investigación es evaluar la presencia de determinantes genéticos de virulencia en el gen E implicados en cambios fenotípicos in vitro en cepas de DENV-2 que ocasionaron diferentes cuadros clínicos de la enfermedad durante el 2013. Se seleccionarán 20 muestras de suero serotipificadas como DENV-2 y provenientes de pacientes con dengue (n=10) y dengue grave (n=10). Se realizará extracción del RNA viral, amplificación, secuenciación del gen E y análisis filogenético para determinar el genotipo viral. Para determinar la función potencial de las sustituciones nucleotídicas encontradas y su contribución al fenotipo de las cepas, se realizará análisis comparativo in silico. Para evaluar las diferencias fenotípicas, se determinará el tamaño de placa y se realizarán cinéticas de replicación viral en células Vero, para lo cual se colectarán sobrenadantes a diferentes tiempos post-infección y se cuantificará la progenie viral mediante titulación por ensayo de placa y/o RT-qPCR. Esta investigación permitirá evaluar la presencia de determinantes genéticos de virulencia en DENV-2 implicados en el desarrollo de características fenotípicas in vitro. La base genética de dichas diferencias contribuirá a la definición de marcadores virológicos pronósticos de la severidad.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Búsqueda de determinantes de virulencia en el genoma del virus dengue y su potencial contribución a la patogénesis del dengue grave durante las dos últimas epidemias en Colombia
    Inicio: Enero  2015 Duración 
    Resumen

    El dengue es la enfermedad viral transmitida por artrópodos más importante en países tropicales y subtropicales. Se estima que en el mundo ocurren alrededor de 390 millones de infecciones cada año, de las cuales entre 50 y 100 millones cursan con manifestaciones clínicas. En Colombia, la re-emergencia del dengue ocurrió a principios de los años 1970¿s y desde entonces se ha observado un incremento en la incidencia, aparición de formas graves y un incremento en la letalidad por dengue grave. Aunque múltiples factores determinan el desenlace clínico de la enfermedad, el virus es reconocido como un importante componente de la patogénesis. Estudios de epidemiología molecular permitieron tener las primeras evidencias del papel del genotipo viral en la severidad de la enfermedad. Posteriormente, estudios in vitro e in vivo han permitido corroborar las diferencias entre cepas de diferentes genotipos en características tales como las tasas de replicación viral y la virulencia. A pesar de las múltiples evidencias, los determinantes de virulencia en el genoma de los diferentes serotipos del virus dengue aún no han sido plenamente caracterizados. En este estudio se propone la caracterización in vitro y secuenciación de cepas de virus dengue aisladas de pacientes cuya clasificación final ajustada en el SIVIGILA haya sido de dengue sin signos de alarma, dengue grave ó mortalidad por dengue, durante el período 2010-2014. Se seleccionarán dos grupos. En el primer grupo se incluirán 40 sueros (10 de cada serotipo) de pacientes cuya clasificación final haya sido ¿dengue sin signos de alarma¿. El segundo grupo incluirá 40 sueros (10 de cada serotipo) de pacientes cuya clasificación haya sido ¿dengue grave¿ ó ¿mortalidad por dengue¿. Luego del aislamiento en células de mosquito C6/36, cada sobrenadante será titulado mediante ensayo de placa y RT-PCR en tiempo real. Posteriormente, se realizarán curvas de crecimiento de un paso tanto en células de mosquito como en células de mamífero (Vero). Los genomas de aquellas cepas que presenten diferencias en sus curvas de crecimiento, así como el de aquellas cepas provenientes de pacientes con los diferentes cuadros de la enfermedad, serán obtenidos mediante secuenciación de última generación (NGS). Los resultados obtenidos in vitro, tales como curvas de crecimiento, fenotipo de placa y tasas de replicación, así como el análisis in silico de los genomas virales secuenciados nos permitirá identificar potenciales marcadores genéticos que se correlacionen con diferencias in vitro y con diferencias en el desenlace clínico de la enfermedad. Dichos determinantes genéticos de virulencia, al ser implementados en la vigilancia virológica del dengue, nos permitirán predecir el impacto de las cepas circulantes o aquellas que eventualmente sean importadas y se convierten por ende en marcadores pronósticos al nivel poblacional, del potencial patogénico de los virus circulantes.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Coinfección de virus de la hepatitis E con otras hepatitis virales. Colombia. 2006 - 2011
    Inicio: Enero  2014 Fin: Agosto  2015 Duración 
    Resumen

    El virus de la Hepatitis E (VHE) está ampliamente distribuido a nivel mundial. Epidemiológicamente se ha planteado la existencia de cepas con comportamiento epidémico, las cuales se presentan en forma de brotes explosivos de hepatitis viral aguda asociados al consumo de agua contaminada (1) y no epidémicas, las cuales son causantes de casos esporádicos en países en vía de desarrollo e industrializados, principalmente de trasmisión zoonótica por los cerdos (2,3). Esta forma de hepatitis fue llamada en un principio hepatitis no-A/no-B de transmisión entérica (ET-NANBH), para distinguirla de la hepatitis vírica no-A/no-B de transmisión parenteral (hepatitis C) (2). El VHE pertenece a la familia Hepeviridae y es el único miembro del género Hepevirus, posee un genoma ARN de cadena simple, de sentido positivo, con una talla de 7,2 kb y cuenta con 3 marcos abiertos de lectura (4,5). Se transmite predominantemente por vía fecal oral, a través de agua contaminada y es uno de los seis principales virus capaces de causar un cuadro clínico de hepatitis viral en el hombre, provocando cuadros de hepatitis fulminante en mujeres embarazadas alcanzando hasta un 20% de letalidad (1,6). La presencia de hepatitis E en Canadá, Estados Unidos y países desarrollados de Europa ha sido descrita como una enfermedad importada, se ha considerado que la prevalencia de anticuerpos anti VHE es diez veces mayor que la prevalencia de anticuerpos anti VHC en estos mismos países, donde el VHC produce 20% o más de las hepatitis clínicas. Asimismo la prevalencia de anticuerpos contra el VHE en regiones no endémicas ha sido mucho mayor a lo que se esperaba (1 a 3%) (6). Igualmente se ha evidenciado la existencia de hepatitis E en países desarrollados de Sur América como Brasil, donde se reporto la presencia de anticuerpos específicos de clase IgG anti VHE en sueros de diferentes grupos de pacientes, estos resultados indican que los pacientes han tenido contacto con el virus (7,1). En el país hasta el momento es poca la información que se tiene de estudios sobre la presencia de VHE pero que confirman la circulación del virus (19,20). El objetivo del proyecto será detectar serológica y molecularmente la coinfección de VHE con virus hepatotropos (VHA, VHB, VHC), en sueros con diagnóstico positivo para: VHA: IgM (+), VHB: HBsAg (+), VHC: RIBA (+), los cuales se encuentran conservados en la seroteca del Grupo de Virología del Instituto Nacional de Salud. A partir de la metodología propuesta se espera detectar un porcentaje de seroconversión y coinfección en los sueros seleccionados. Los resultados obtenidos generarán nuevo conocimiento sobre la coinfección de VHE con otros virus hepatotropos y nuevas preguntas de investigación que serán abordadas o tratadas a futuro.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Identificación de genotipos del virus de la hepatitis B (VHB) y mutaciones en los genes P y S, en muestras de sueros procedentes de catorce departamentos de Colombia, 2000 - 2011
    Inicio: Enero  2014 Fin: Enero  2016 Duración 
    Resumen

    La hepatitis B es una infección viral hepática potencialmente mortal. Es un importante problema de salud pública y es el tipo más grave de hepatitis vírica en todo el mundo. Puede causar patología hepática crónica y conlleva un alto riesgo de muerte por cirrosis hepática y cáncer hepático. A nivel mundial se estima que dos mil millones de personas han sido infectadas con VHB y más de 350 millones con infección hepática crónica. Alrededor de seiscientas mil personas mueren cada año debido a las consecuencias graves de la hepatitis B. (WHO, 2008). Alrededor del 25% de los adultos con infección crónica adquirida en la infancia mueren de cáncer de hígado o cirrosis (cicatrización del hígado) causada por la infección crónica. El VHB es de cincuenta a cien veces más infeccioso que el Virus de la Inmunodeficiencia Humana (VIH) y es un importante riesgo laboral para los trabajadores de salud. (WHO, 2008). A nivel mundial la Hepatitis B es endémica en China y otras zonas de Asia, donde la mayoría de las infecciones se producen durante la infancia. También hay tasas elevadas de infección crónica en el sur de Europa oriental y central. Se calcula que un 2% a 5% de la población de Oriente Medio y del subcontinente indiano padece infección crónica. En Europa occidental y Norteamérica, la población con infección crónica no llega al 1%. (WHO, 2008).

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Desarrollo de herramientas para el estudio de la biología molecular del virus de la encefalitis de Saint Louis (SLEV)
    Inicio: Junio  2012 Fin proyectado: Diciembre  2013 Fin: Junio  2014 Duración 24
    Resumen

    Colombia es considerado un país mega-diverso, con miles de especies biológicas descritas y miles por descubrir. Tal realidad no solamente aplica a las especies macroscópicas, sino también a microorganismos y virus. En los últimos años, se ha notado una preocupación por la cada vez mas frecuente aparición de brotes de enfermedades cuyo agente etiológico es en la mayoría de los casos desconocido. Esto refleja la alta diversidad de patógenos que seguramente circulan en nuestro entorno sin ser detectados y evidencia nuestra incapacidad para identificarlos, paso indispensable para establecer acciones que permitan su control.