Hoja de vida

Par evaluador reconocido por Minciencias.
Categoría Investigador Junior (IJ) con vigencia hasta la publicación de los resultados de la siguiente convocatoria
Nombre Nicolas Pinel Peláez
Nombre en citaciones PINEL PELÁEZ, NICOLAS
Nacionalidad Colombiana
Sexo Masculino

Redes sociales académicas

Google Scholar
Linkedln

Identificadores de autor

Autor ID (Scopus)
Open Researcher and Contributor ID (ORCID)

Formación Académica

  •  
  • Doctorado University Of Washington
    Microbiology
    Septiembrede2001 - Agostode 2009
    Physiological and Genomic Insights into the Biology of Verminephrobacter eiseniae, a Bacterial Symbiont of the Earthworm Eisenia fetida.
  •  
  • Pregrado/Universitario University Of Miami
    Microbiology and Immunology
    Agostode1997 - Juniode 2001
  •  
  • Secundario Colegio San Ignacio De Loyola

    Enerode1991 - Diciembrede 1996

    Estancias posdoctorales

  •  
  • Post-doctoral Fellow Institute for Systems Biology
    Multi-omics and Systems Biology
    Desde: Febrero de 2011
    Hasta: Julio de 2014

    Experiencia profesional

  •  
  • UNIVERSIDAD EAFIT
    Dedicación:  horas Semanales Julio de 2015 Enero de

    Áreas de actuación

  •  Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Celular y Microbiología
  •  Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Ecología
  •  Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Virología
  •  Ciencias Naturales -- Ciencias de la Tierra y Medioambientales -- Meteorología y Ciencias Atmosféricas
  •  Ciencias Naturales -- Ciencias de la Tierra y Medioambientales -- Ciencias del Medio Ambiente
  •  Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Micología
  • Idiomas

      Habla Escribe Lee Entiende
  •  Italiano
  • Aceptable Deficiente Bueno Bueno
  •  Español
  • Bueno Bueno Bueno Bueno
  •  Portugués
  • Aceptable Deficiente Bueno Aceptable
  •  Francés
  • Aceptable Aceptable Bueno Bueno
  •  Inglés
  • Bueno Bueno Bueno Bueno

    Líneas de investigación

  •  Ecología de patógenos, Activa:Si
  •  Modelación de riesgos ambientales, Activa:Si
  •  Comunidades microbianas, Activa:Si
  •  
    Los ítems de producción con la marca corresponden a productos avalados y validados para la última Convocatoria Nacional para el Reconocimiento y Medición de Grupos de Investigación, Desarrollo Tecnológico o de Innovación y para el Reconocimiento de Investigadores del SNCTeI

    Cursos de corta duración

  • Producción técnica - Cursos de corta duración dictados - Extensión extracurricular
  • JAVIER CORREA ALVAREZ, NICOLAS PINEL PELAEZ, ¿Qué tan diverso es su microbioma?: Medidas de diversidad y similitud en estudios metagenómicos., Finalidad: Enseñanza de teoría y técnicas para el estudio ecológico de comunidades microbianas. . En: Colombia  ,2016,  ,UNIVERSIDAD EAFIT.  participación: Docente , 1 semanas 
    Palabras:
    Ecología microbiana, Microbioma,
    Areas:
    Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Ecología, Ciencias Médicas y de la Salud -- Ciencias de la Salud -- Epidemiología,
    Sectores:
    Salud humana - Otro,

    Trabajos dirigidos/tutorías

  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajo de grado de maestría o especialidad clínica
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, Diversity of the main mucinophilic intestinal microorganisms from Colombian young adults  UNIVERSIDAD EAFIT  Estado: Tesis concluida  Maestría en Ingeniería,  2019. Dirigió como: Tutor principal,   Persona(s) orientada(s):  Diana Paola Farfán Villanueva Tutor(es)/Cotutor(es): JUAN SEBASTIAN ESCOBAR RESTREPO , NICOLAS PINEL PELAEZ , NICOLAS PINEL PELAEZ,
    Areas:
    Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Celular y Microbiología, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología (Teórica, Matemática, Criobiología, Evolutiva),
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Tesis de doctorado
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, Entropy-based graph construction methods for unsupervised data structure detection  UNIVERSIDAD EAFIT  Estado: Tesis concluida  Doctorado en Ingeniería Matemática,  2016. Dirigió como: Coturor/asesor,   Persona(s) orientada(s):  Leandro Fabio Ariza Jiménez Tutor(es)/Cotutor(es): NICOLAS PINEL PELAEZ , NICOLAS PINEL PELAEZ , OLGA LUCIA QUINTERO MONTOYA,
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Tesis de doctorado
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, Carcinoma Pancreatobiliar, Microbiota Local y Composición Proteica de la Bilis  UNIVERSIDAD CES  Estado: Tesis concluida  Doctorado en Ciencias de la Salud,  2016. Dirigió como: ,   Persona(s) orientada(s):  Ariel Antonio ARTETA CUETO Asesor(es): MIRYAN MARGOT SANCHEZ JIMENEZ , NICOLAS PINEL PELAEZ , NICOLAS PINEL PELAEZ,Tutor(es)/Cotutor(es): NORA MARIA CARDONA CASTRO,
    Areas:
    Ciencias Médicas y de la Salud -- Ciencias de la Salud -- Epidemiología, Ciencias Médicas y de la Salud -- Ciencias de la Salud -- Enfermedades Infecciosas, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Celular y Microbiología,
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, Efecto de extractos etanólicos vegetales sobre el crecimiento in vitro de Leucoagaricus gongylophorus  UNIVERSIDAD EAFIT  Estado: Tesis concluida  Biología,  2019. Dirigió como: Tutor principal,   Persona(s) orientada(s):    Tutor(es)/Cotutor(es): DIANA PAOLA FARFAN VILLANUEVA , NICOLAS PINEL PELAEZ,
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajo de grado de maestría o especialidad clínica
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, Low-dimensional binning of metagenomic sequences: performance assessment of the Barnes-Hut t-Stochastic Neighbor Embedding Algorithm using internal cluster validity indices  UNIVERSIDAD EAFIT  Estado: Tesis concluida  MAESTRÍA MATEMÁTICAS APLICADAS,  2017. Dirigió como: Tutor principal,   Persona(s) orientada(s):  Julian Ceballos Cano Tutor(es)/Cotutor(es): LEANDRO FABIO ARIZA JIMENEZ , NICOLAS PINEL PELAEZ , NICOLAS PINEL PELAEZ,
    Areas:
    Ciencias Naturales -- Matemática -- Matemáticas Aplicadas, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología (Teórica, Matemática, Criobiología, Evolutiva),
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, Descripción inicial del ecosistema termo-ácido, el hidrotermal Aguas Calientes, proveniente de la cámara magmática del Nevado del Ruiz y enunciar las comunidades que lo habitan.  UNIVERSIDAD EAFIT  Estado: Tesis concluida  Biología,  2018. Dirigió como: Tutor principal,   Persona(s) orientada(s):  Érika Margarita Corrales Cabra  Tutor(es)/Cotutor(es): NICOLAS PINEL PELAEZ,
    Areas:
    Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Celular y Microbiología,
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, Evaluación de la efectividad del esterilizador de peróxido de hidrógeno Baumer B0201 para la empresa CORPAUL  UNIVERSIDAD EAFIT  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Procesos,  2016. Dirigió como: Tutor principal,   Persona(s) orientada(s):  Andrés Felipe Valencia Londoño y Diego Alejandro Garcés Hoyos  Tutor(es)/Cotutor(es): NICOLAS PINEL PELAEZ,
    Areas:
    Ingeniería y Tecnología -- Otras Ingenierías y Tecnologías -- Otras Ingenierías y Tecnologías,
     

    Jurado en comités de evaluación

  • Datos complementarios - Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado - Maestría
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, Titulo: Mitochondrial Genome Characterization of Tecia solanivora (Lepidoptera:Gelechiidae) and Its phylogenetic relationship with other Lepidopteran Insects Tipo de trabajo presentado: Proyecto de grado/Tesis en:  UNIVERSIDAD EAFIT  programa académico Maestría en Ingeniería  Nombre del orientado: Viviana Ramírez Ríos  
  • Datos complementarios - Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado - Pregrado
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, Titulo: Ensamble y caracterización genómica de cepas de Bacillus subtilis aisladas de Musa AAA con miras al mejoramiento biotecnológico de bioinoculantes Tipo de trabajo presentado: Proyecto de grado/Tesis en:  UNIVERSIDAD EAFIT  programa académico Ingeniería de Procesos  Nombre del orientado: Nicolás David Franco Sierra  
  • Datos complementarios - Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado - Pregrado
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, Titulo: Potential Distribution of Pangasianodon hypophthalmus (Siluriformes: Pangasiidae) in Colombia: Implications for the Management and Conservation of Andean Fish Tipo de trabajo presentado: Proyecto de grado/Tesis en:  UNIVERSIDAD EAFIT  programa académico Biología  Nombre del orientado: María Camila Castellanos Mejía  
  • Datos complementarios - Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado - Pregrado
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, Titulo: Comparison of the variation of gut bacterial diversity marker genes in public genomes: a study case of the class Clostridia Tipo de trabajo presentado: Proyecto de grado/Tesis en:  UNIVERSIDAD EAFIT  programa académico Biología  Nombre del orientado: María Cadavid Vélez  
  • Datos complementarios - Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado - Maestría
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, Titulo: Microbiota intestinal en la occidentalización de la población colombiana Tipo de trabajo presentado: Proyecto de grado/Tesis en:  UNIVERSIDAD CES  programa académico Maestría en Ciencias Biológicas  Nombre del orientado: Juan Jacobo de la Cuesta Zuluaga  

    Eventos científicos

    1 Nombre del evento: Second Workshop on Atmospheric Pollution and its impact on human health, agriculture and natural ecosystems: a mathematical modeling perspective.  Tipo de evento: Taller  Ámbito: Internacional  Realizado el:2018-09-28 00:00:00.0,  2018-09-28 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Universidad EAFIT  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Potential Impacts of Urban Atmospheric Pollution on Distant Ecosystems Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD EAFIT Tipo de vinculaciónGestionadora
    Participantes
    • Nombre: ANDRES PAREJA LOPEZ Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: ANDRES YARCE BOTERO Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: ANGELA MARIA RENDON MESA Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: MONICA LUCIA ALVAREZ LAINEZ Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: NESTOR Y ROJAS ROA Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: NICOLAS PINEL PELAEZ Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: OLGA LUCIA QUINTERO MONTOYA Rol en el evento: Organizador , Ponente
    • Nombre: SANTIAGO LOPEZ RESTREPO Rol en el evento: Ponente
    2 Nombre del evento: First Workshop on Atmospheric Pollution and its impact on human health, agriculture and natural ecosystems: a mathematical modeling perspective.  Tipo de evento: Taller  Ámbito: Internacional  Realizado el:2017-09-25 00:00:00.0,  2017-09-27 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Universidad EAFIT  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD EAFIT Tipo de vinculaciónGestionadora
    Participantes
    • Nombre: ANDRES YARCE BOTERO Rol en el evento: Asistente
    • Nombre: ANGELA MARIA RENDON MESA Rol en el evento: Asistente
    • Nombre: JAN WILLEM ERISMAN Rol en el evento: Ponente magistral
    • Nombre: MARTIJN SCHAAP Rol en el evento: Ponente magistral
    • Nombre: NESTOR Y ROJAS ROA Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: NICOLAS PINEL PELAEZ Rol en el evento: Organizador , Traductor simultaneo
    • Nombre: OLGA LUCIA QUINTERO MONTOYA Rol en el evento: Asistente
    • Nombre: SANTIAGO LOPEZ RESTREPO Rol en el evento: Asistente
    3 Nombre del evento: Cátedra EAFIT Biodiversa: Conservación de plantas en Colombia, Lista Roja de Especies y planificación estratégica.  Tipo de evento: Seminario  Ámbito: Nacional  Realizado el:2018-04-23 00:00:00.0,  2018-04-23 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Universidad EAFIT  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD EAFIT Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: CRISTINA LOPEZ GALLEGO Rol en el evento: Ponente magistral
    • Nombre: NICOLAS PINEL PELAEZ Rol en el evento: Organizador
    4 Nombre del evento: Cátedra EAFIT Biodiversa: Microbiota intestinal, una nueva mirada a unos viejos amigos.  Tipo de evento: Seminario  Ámbito: Nacional  Realizado el:2017-04-24 00:00:00.0,  2017-04-24 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Universidad EAFIT  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD EAFIT Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: JUAN SEBASTIAN ESCOBAR RESTREPO Rol en el evento: Ponente magistral
    • Nombre: NICOLAS PINEL PELAEZ Rol en el evento: Organizador
    5 Nombre del evento: Cátedra EAFIT Biodiversa: Modelización de distribución y diversidad de especies de orquídeas para su conservación.  Tipo de evento: Seminario  Ámbito: Nacional  Realizado el:2016-10-10 00:00:00.0,  2016-10-10 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Universidad EAFIT  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD EAFIT Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: NICOLAS PINEL PELAEZ Rol en el evento: Organizador
    6 Nombre del evento: Cátedra EAFIT Biodiversa: Ecología Urbana en el Valle de Aburrá.  Tipo de evento: Seminario  Ámbito: Nacional  Realizado el:2016-02-29 00:00:00.0,  2016-02-29 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Universidad EAFIT  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD EAFIT Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: CARLOS ANDRES DELGADO VELEZ Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: JUAN FERNANDO DIAZ NIETO Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: NICOLAS PINEL PELAEZ Rol en el evento: Organizador , Ponente
    • Nombre: ROSANA ARIZMENDI-MEJIA Rol en el evento: Ponente
    7 Nombre del evento: Congreso Colombiano de Ecología  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2018-11-06 00:00:00.0,  2018-11-09 00:00:00.0   en POPAYÁN   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Amenazas a las Áreas Protegidas y Ecosistemas Estratégicos de Colombia por el Transporte Atmosférico de Contaminantes Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    • Nombre del producto:Descripción inicial del ecosistema termo-ácido hidrotermal Aguas Calientes, ubicado en el superpáramo del Nevado del Ruiz Tipo de producto:Demás trabajos - Demás trabajos - Póster
    • Nombre del producto:Descripción inicial de la ecología de Thunbergia alata en el oriente antioqueño para la identificación de estrategias de control de esta planta invasora Tipo de producto:Demás trabajos - Demás trabajos - Póster
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:AVIANCA S.A. Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    • Nombre de la institución:Colegio Nacional de Ecólogos Tipo de vinculaciónGestionadora
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD DEL CAUCA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    • Nombre de la institución:Arasarí Conservación e Investigación S.A.S. Tipo de vinculaciónGestionadora
    • Nombre de la institución:CORPORACIÓN UNIVERSITARIA COMFACAUCA - UNICOMFACAUCA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    • Nombre de la institución:CORPORACIÓN UNIVERSITARIA AUTÓNOMA DEL CAUCA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    • Nombre de la institución:Corporación Autónoma Regional del Cauca Tipo de vinculaciónGestionadora
    Participantes
    • Nombre: ERIKA MARGARITA CORRALES CABRA Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: NICOLAS PINEL PELAEZ Rol en el evento: Ponente , Ponente magistral
    8 Nombre del evento: 40th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC)  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2018-07-18 00:00:00.0,  2018-07-21 00:00:00.0   en Honolulu   - Honolulu Convention Center  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Unsupervised fuzzy binning of metagenomic sequence fragments on three-dimensional Barnes-Hut t-stochastic Neighbor embeddings Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:IEEE Tipo de vinculaciónGestionadora
    Participantes
    • Nombre: LEANDRO FABIO ARIZA JIMENEZ Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: NICOLAS PINEL PELAEZ Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: OLGA LUCIA QUINTERO MONTOYA Rol en el evento: Ponente
    9 Nombre del evento: Fourth Workshop on Atmospheric Pollution and its impact on human health, agriculture and natural ecosystems.  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Internacional  Realizado el:2020-10-02 00:00:00.0,  2020-10-02 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Evento en vivo a través de la plataforma Teams con transmisión pública  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD EAFIT Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: NICOLAS PINEL PELAEZ Rol en el evento: Organizador
    10 Nombre del evento: XII Días de la Ciencia Aplicada - 2020  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Internacional  Realizado el:2020-09-23 00:00:00.0,  2020-09-24 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Transmisión en vivo  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Microorganismos y Cambio Climático Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD EAFIT Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: NICOLAS PINEL PELAEZ Rol en el evento: Ponente
    11 Nombre del evento: Third Workshop on Atmospheric Pollution and its Impacts on Human Health, Agriculture and Natural Ecosystems: A Mathematical Perspective.  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Internacional  Realizado el:2019-09-27 00:00:00.0,  2019-09-27 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Universidad EAFIT  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Scenarios & Simulations for an atmosphere-savy regional planning Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD EAFIT Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: NICOLAS PINEL PELAEZ Rol en el evento: Organizador , Ponente

    Estrategias pedagógicas para el fomento a la CTI

    Nombre de la estrategia Semillero para el estudio de ecología de plantas y suelos (SAMFUND)  Inicio enAgosto - 2015,  Finalizó en :Diciembre - 2015, 
    Nombre de la estrategia Los nuevos ecólogos de Capurganá  Inicio enOctubre - 2016,  Finalizó en :Octubre - 2016, 
    Nombre de la estrategia Semillero de investigación en extremófilos y astrobiología (SIAB)  Inicio enEnero - 2017,  Finalizó en :Diciembre - 2017, 
    Nombre de la estrategia Semillero de investigación en extremófilos y astrobiología (SIAB)  Inicio enEnero - 2018,  Finalizó en :Diciembre - 2018, 
    Nombre de la estrategia Semillero de investigación en extremófilos y astrobiología (SIAB)  Inicio enAgosto - 2015,  Finalizó en :Diciembre - 2015, 
    Nombre de la estrategia Semillero para el estudio de ecología de plantas y suelos (SAMFUND)  Inicio enEnero - 2016,  Finalizó en :Diciembre - 2016, 
    Nombre de la estrategia Semillero de investigación en extremófilos y astrobiología (SIAB)  Inicio enEnero - 2016,  Finalizó en :Diciembre - 2016, 

    Espacios de participación ciudadana

     Nombre del espacioErradicatón de Ojo de Poeta  Realizado el:2018-12-13 00:00:00.0,  2018-12-13 00:00:00.0   en MEDELLÍN   -   Con8 participantes 

    Publicaciones editoriales no especializadas

  • Divulgación pública de la ciencia - Publicaciones editoriales no especializadas: cartillas, manual no especializado, periódicos, revistas, boletín, etc
  • Nombre del producto: ¿Cómo es la vida en ambiente extremos?,  Fecha de presentación: 2016 - Noviembre,  Ciudad: MEDELLÍN-ANTIOQUIA-Colombia,  Medio de verificación: https://publicaciones.eafit.edu.co/index.php/revista-catalejo/issue/view/557,  Ruta de circulación: Con cobertura sobre todo el territorio nacional,  Proyecto vinculado: Comunicación de las ciencias a niños y jóvenes en un contexto universitario: sistematización del pro

    Desarrollos web

  • Divulgación pública de la ciencia - Desarrollos web: Páginas web-blogs, micrositios, aplicativos móviles + estrategia de Redes Sociales
  • Nombre del producto: Modelación matemática para predecir la calidad del aire,  Fecha de presentación: 2020 - Diciembre,  Ciudad: MEDELLÍN-ANTIOQUIA-Colombia,  Medio de verificación: https://www.eafit.edu.co/investigacion/noticias/Paginas/modelacion-matematica-para-predecir-la-calid,  Ruta de circulación: Con cobertura sobre todo el territorio nacional,  Proyecto vinculado: Modelos de exposición humana a la contaminación atmosférica en áreas urbanas como herramienta de toma de decisiones (Exposure to Pollutants Regional Research ExPoR2)

    Artículos

  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, "Alignment-free visualization of metagenomic data by nonlinear dimension reduction." . En: Colombia 
    Scientific Reports  ISSN: 2045-2322  ed: Nature Publishing Group
    v.4 fasc.NA p.4516 - ,2014,  DOI: 10.1038/srep04516
    Palabras:
    Metagenómica, Ómicas,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, "Verminephrobacter eiseniae gen. nov., sp. nov., a nephridial symbiont of the earthworm Eisenia foetida (Savigny)." . En: Estados Unidos 
    International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology  ISSN: 1466-5034  ed: Microbiology Society
    v.58 fasc.9 p.2147 - 2157 ,2008,  DOI: 10.1099/ijs.0.65174-0
    Palabras:
    Eisenia, Evolución, Simbiosis, Verminephrobacter,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, "Genes for the cytoskeletal protein tubulin in the bacterial genus Prosthecobacter." . En: Estados Unidos 
    PNAS Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  ISSN: 1091-6490  ed: Georgian National Academy of Sciences
    v.99 fasc.26 p.17049 - 17054 ,2002,  DOI: 10.1073/pnas.012516899
    Palabras:
    Evolución, Prosthecobacter, Verrucomicrobia, Tubulin,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, "Spatial and temporal variability in a stratified hypersaline microbial mat community." . En: Estados Unidos 
    Fems Microbiology Ecology  ISSN: 1574-6941  ed: Oxford University Press (UK)
    v.68 fasc.1 p.46 - 58 ,2009,  DOI: 10.1111/j.1574-6941.2009.00647.x
    Palabras:
    Metagenómica, Halófilos, Comunidades microbianas,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, "Nitrosopumilus maritimus genome reveals unique mechanisms for nitrification and autotrophy in globally distributed marine crenarchaea." . En: Estados Unidos 
    PNAS Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  ISSN: 1091-6490  ed: Georgian National Academy of Sciences
    v.107 fasc.19 p.8818 - 8823 ,2010,  DOI: 10.1073/pnas.0913533107
    Palabras:
    Genoma, Nitrosopumilus, Archaea,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, "Recovery of temperate Desulfovibrio vulgaris bacteriophage using a novel host strain." . En: Estados Unidos 
    Environmental Microbiology  ISSN: 1462-2920  ed: Wiley-VCH Verlag Berlin GmbH
    v.8 fasc.11 p.1950 - 1959 ,2006,  DOI: 10.1111/j.1462-2920.2006.01075.x
    Palabras:
    Desulfovibrio, Evolución, Genoma,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Corto (Resumen)
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, "Genome Sequence of the Thermophilic Cyanobacterium Thermosynechococcus sp. Strain NK55a." . En: Estados Unidos 
    Genome Announcements  ISSN: 2169-8287  ed: American Society for Microbiology
    v.2 fasc.1 p.e01060-13 - ,2014,  DOI: 10.1128/genomeA.01060-13
    Palabras:
    Genoma, Cianobacteria,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, "Contribution of mobile genetic elements to Desulfovibrio vulgaris genome plasticity." . En: Estados Unidos 
    Environmental Microbiology  ISSN: 1462-2920  ed: Wiley-VCH Verlag Berlin GmbH
    v.11 fasc.9 p.2244 - 2252 ,2009,  DOI: 10.1111/j.1462-2920.2009.01946.x
    Palabras:
    Desulfovibrio, Evolución, Genoma,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, "Model organisms retain an "ecological memory" of complex ecologically relevant environmental variation." . En: Estados Unidos 
    Applied and Environmental Microbiology  ISSN: 1098-5336  ed: American Society for Microbiology
    v.80 fasc.6 p.1821 - 1831 ,2014,  DOI: 10.1128/AEM.03280-13
    Palabras:
    Evolución, Genoma, Halófilos, Halobacterium,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Corto (Resumen)
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, "Genome Sequence of "Candidatus Microthrix parvicella" Bio17-1, a Long-Chain-Fatty-Acid-Accumulating Filamentous Actinobacterium from a Biological Wastewater Treatment Plant." . En: Estados Unidos 
    Journal of Bacteriology  ISSN: 1098-5530  ed: American Society for Microbiology
    v.194 fasc.23 p.6670 - 6671 ,2012,  DOI: 10.1128/JB.01765-12
    Palabras:
    Genoma, Evolución, Microthrix,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, "Metabolic modeling of a mutualistic microbial community." . En: Estados Unidos 
    Molecular Systems Biology  ISSN: 1744-4292  ed: Wiley-VCH Verlag Berlin GmbH
    v.3 fasc.1 p.92 - ,2007,  DOI: 10.1038/msb4100131
    Palabras:
    Desulfovibrio, Evolución, Genoma, Methanococcus, Comunidades microbianas,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, "Purifying Selection and Molecular Adaptation in the Genome of Verminephrobacter, the Heritable Symbiotic Bacteria of Earthworms." . En: Estados Unidos 
    Genome Biology and Evolution  ISSN: 1759-6653  ed: Oxford University Press (UK)
    v.4 fasc.3 p.307 - 315 ,2012,  DOI: 10.1093/gbe/evs014
    Palabras:
    Evolución, Eisenia, Genoma, Verminephrobacter,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, "Community-integrated omics links dominance of a microbial generalist to fine-tuned resource usage." . En: Estados Unidos 
    Nature Communications  ISSN: 2041-1723  ed: Nature Publishing Group
    v.5 fasc.N/A p.5603 - 5612 ,2014,  DOI: 10.1038/ncomms6603
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, "IMP: a pipeline for reproducible reference-independent integrated metagenomic and metatranscriptomic analyses" . En: Estados Unidos 
    Genome Biology  ISSN: 1474-760X  ed: BioMed Central Ltd.
    v.17 fasc.NA p.260 - ,2016,  DOI: 10.1186/s13059-016-1116-8
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, OLGA LUCIA QUINTERO MONTOYA, ANDRES YARCE BOTERO, SANTIAGO LOPEZ RESTREPO, "Urban Air Quality Modeling Using Low-Cost Sensor Network and Data Assimilation in the Aburrá Valley, Colombia" . En:  
    Atmosphere  ISSN: 2073-4433  ed: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
    v.12 fasc.1 p.91 - 91 ,2021,  DOI: 10.3390/atmos12010091
  • Producción bibliográfica - Artículo - Revisión (Survey)
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, OLGA LUCIA QUINTERO MONTOYA, ELIAS DAVID NINO RUIZ, "On the mathematical modelling and data assimilation for air pollution assessment in the Tropical Andes" . En:  
    Environmental Science And Pollution Research  ISSN: 1614-7499  ed: Springer-Verlag London Ltd.
    v.27 fasc.29 p.35993 - 36012 ,2020,  DOI: 10.1007/s11356-020-08268-4
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • OLGA LUCIA QUINTERO MONTOYA, NICOLAS PINEL PELAEZ, ANDRES YARCE BOTERO, SANTIAGO LOPEZ RESTREPO, "Forecasting PM10 and PM2.5 in the Aburrá Valley (Medellín, Colombia) via EnKF based data assimilation" . En:  
    Atmospheric Environment  ISSN: 1352-2310  ed: Pergamon-Elsevier Science Ltd
    v.232 fasc. p.117507 - 117507 ,2020,  DOI: 10.1016/j.atmosenv.2020.117507
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, "Earthworm symbiont Verminephrobacter eiseniae mediates natural transformation within host egg capsules using type IV pili." . En: Estados Unidos 
    Frontiers in Microbiology  ISSN: 1664-302X  ed: Frontiers Media S.A.
    v.5 fasc.NA p.546 - 555 ,2014,  DOI: 10.3389/fmicb.2014.00546
    Palabras:
    Eisenia, Simbiosis, Transformación Natural, Verminephrobacter,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, "Recognition of the basidiomycetous yeast Sporobolomyces ruberrimus sp. nov. as a distinct species based on molecular and morphological analyses." . En: Estados Unidos 
    FEMS Yeast Research  ISSN: 1567-1364  ed: Oxford University Press (UK)
    v.1 fasc.4 p.265 - 270 ,2002,  DOI: 10.1111/j.1567-1364.2002.tb00044.x
    Palabras:
    Basidiomicetos, Levaduras, Sporobolomyces,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, "Erosion of functional independence early in the evolution of a microbial mutualism." . En: Estados Unidos 
    PNAS Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  ISSN: 1091-6490  ed: Georgian National Academy of Sciences
    v.111 fasc.41 p.14822 - 14827 ,2014,  DOI: 10.1073/pnas.1407986111
    Palabras:
    Simbiosis, Desulfovibrio, Methanococcus, Bacterias Reductoras de Sulfato, Sintrofismo,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Corto (Resumen)
  • NICOLAS PINEL PELAEZ, OLGA LUCIA QUINTERO MONTOYA, LEANDRO FABIO ARIZA JIMENEZ, "Unsupervised fuzzy binning of metagenomic sequence fragments on three-dimensional Barnes-Hut t-Stochastic Neighbor Embeddings" . En: Estados Unidos 
    Conference Proceedings: Annual International Conference Of The Ieee Engineering In Medicine And Biology Society. Ieee Engineering In Medicine And Biology Society. Conference  ISSN: 1557-170X  ed: Ieee Engineering In Medicine And Biology Society
    v.2018 fasc.N/A p.1315 - 1318 ,2018,  DOI: 10.1109/EMBC.2018.8512529
    Palabras:
    Metagenómica, Microbioma, Ómicas,

    Documentos de trabajo

    Producción bibliográfica - Documento de trabajo (Working Paper)
    NICOLAS PINEL PELAEZ, DIEGO FERNANDO VILLANUEVA MEJIA, VALESKA VILLEGAS ESCOBAR, "Documento Maestro para la Creación del Programa Académico Maestría en Biociencias" En: . 2018. p.
    Areas:
    Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Celular y Microbiología, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología (Teórica, Matemática, Criobiología, Evolutiva),

    Proyectos

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Estudios de la biología y distribución de la especie invasora Ojo de Poeta (Thunbergia alata) en el área de influencia del Parque Arví para el diseño de estrategias eficaces y optimizadas de control y manejo - Fase 2
    Inicio: Noviembre  2018 Fin: Enero  2019 Duración 
    Resumen

    La planta Thunbergia alata (Ojo de Poeta) se encuentra ampliamente distribuida en el Corregimiento de Santa Elena (Municipio de Medellín), incluyendo en el Parque Regional Ecoturístico Arví. T. alata ha sido catalogada por el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt como de alto potencial invasivo en el territorio colombiano. Aunque la presencia de T. alata se ha reportado en todos los municipios andinos de Colombia, su poder invasivo parece potenciarse en los suelos antioqueños. La Corporación Autónoma Regional de las Cuencas de los Ríos Negro-Nare (CORNARE) ha determinado que T. alata debe ser controlada y erradicada (Circular No. 29 del 20 de noviembre de 2015). En este sentido, La Corporación Parque Arví es responsable por el control y la erradicación de T. alata dentro de sus zonas de influencia de Santa Elena, control que requiere efectuar manualmente, dada la prohibición a la utilización de herbicidas en reservas hídricas. Estudios previos realizados en la Fase I de esta investigación identificaron estrategias de manejo de residuos que mantienen la inocuidad del material vegetal acumulado durante campañas de remoción de T. alata. Igualmente, el trabajo identificó como uno de los grandes obstáculos en el control de invasión, la gran capacidad dispersora de la planta y la magnitud del banco de semillas. En terrenos recientemente despejados de T. alata las semillas latentes pueden germinar en cuestión de días para producir hasta mil plántulas por metro cuadrado. La segunda fase de la investigación busca refinar los métodos de remoción y tiempos de seguimiento de los sitios tratados con el fin de establecer protocolos de control y monitoreo. Esta fase busca además ahondar en los detalles de dispersión de T. alata con el fin de diseñar planes de prevención de invasión por parte de la planta dentro de las áreas de influencia del Parque Arví. Adicionalmente, se propone desarrollar observaciones de interacciones químicas realizadas durante la Fase 1 buscando estrategias de aceleramiento de la germinación de semillas con el fin de agilizar los tiempos de monitoreo de las áreas despejadas. Finalmente, la investigación propuesta busca explorar e identificar algunos factores que puedan explicar las diferencias en el comportamiento invasivo de la planta manifestado en los suelos antioqueños con el fin de prevenir la continua expansión de la especie en el territorio.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Caracterización del viroma y bacterioma de las especies urbanas y periurbanas de murciélagos (Orden Chiroptera) dominantes en el Valle de Aburrá para la identificación de microorganismos con potencial zoonótico - Fase 2
    Inicio: Enero  2018 Fin: Diciembre  2018 Duración 
    Resumen

    Las enfermedades emergentes de carácter zoonótico representan un riesgo global en aumento, en parte a raíz de la expansión de las áreas urbanas hacia zonas rurales o silvestres y del calentamiento global. Los murciélagos (Orden Chiroptera) son considerados un grupo de gran potencial zoonótico. Distintas especies de murciélagos han sido identificadas como portadoras, y en algunos casos transmisoras, de virus como el virus de la Rabia, el Nipah y el Hendra, el Coronavirus del SARS y del MERS, y otros virus capaces de infectar poblaciones humanas. En murciélagos se han revelado una gran diversidad de virus previamente desconocidos, incluyendo nuevos serotipos de Influenza A. Igualmente se ha identificado a los murciélagos como portadores de especies de bacterias como Leptospira, Bartonella, Rickettsia y Campylobacter, capaces de causar enfermedades zoonóticas. El estudio metagenómico de las comunidades virales y bacterianas asociadas con murciélagos ha ampliado la capacidad de identificación de virus y bacterias, permitiendo descubrir en ellos nuevos agentes con potencial zoonótico. El proyecto propone caracterizar, mediante estudios metagenómicos de virus y bacterias, el potencial zoonótico de las principales especies de murciélagos de las zonas urbanas y periurbanas del Valle de Aburrá. Este objetivo constituye una prioridad para: 1) la identificación temprana de posibles agentes zoonóticos a los que estén expuestos los residentes de Medellín y del Valle de Aburrá; 2) la construcción de una base de datos que permita la implementación de programas de monitoreo de agentes zoonóticos de la región; 3) la formulación inicial de modelos de riesgo de exposición a agentes zoonóticos; y 4) el desarrollo de planes de manejo ambiental adecuados que salvaguarden la salud humana y preserven las funciones ecosistémicas de las especies silvestres involucradas. El presente proyecto representa el primer esfuerzo en su estilo a nivel nacional. Con los resultados obtenidos se contribuirá a la preservación de la salud humana. Simultáneamente, se contribuirá al desarrollo y posicionamiento científico de la universidad y del país mediante la formación de un estudiante de maestría, la generación de datos genómicos y poblacionales de los animales colectados, y la caracterización de los microbiomas de especies de murciélagos hasta el momento no estudiadas desde dicha perspectiva.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Data Assimilation Schemes in Colombian Geodynamics; Cooperative Research Plan for 2017-2020 Between Universidad EAFIT and TUDelft, with the help of Universidad de Antioquia
    Inicio: Enero  2017 Duración 
    Resumen

    The Data Assimilation project seeks to strengthen the relationship between Universidad EAFIT (Colombia) and TU-DELFT University (the Netherlands), with the support of TNO and Deltares (The Netherlands), through the training of doctorate students in Mathematical Engineering. This project counts with satelite databases which provide information of meteorological and environmental variables in a region that includes parts of South, Center and North America. Currently a preliminar processing of available data is being performed such that a better understanding of the temporal and spatial evolution of the variables of interest (such as the emission of harmful substances) can be achieved. In the future, the project has the objective of developing new data assimiliation schemes over LOTOS‐EUROS model, to be able to predict the evolution of the variables at a greater resolution, in order to aid environmental protection and provide new knowledge in applied mathemathics. Research Interests Mathematical ‐ Modeling The Colombian air quality dynamics analysis will be develop through the use of the LOTOS‐EUROS Model from TNO looking for the cooperation between Universities and Institutions. Seeking for the improvement and development of new Data Assimilation Schemes from Mathematical point of view for two applications regarding the Geosciences, Geophysics and Environmental issues. We propose at least seven theoretical aspects related to the Data Assimilation Schemes regarding the Backtracking localization strategies for Ensemble Kalman Filter and the traj4D‐Var proposed by (Fu et al, 2015 and Lu et al, 2015), also the application of Observational impact analysis algorithm (TSBOI‐MM) (Verlaan and Sumihar, 2016) in order to establish a research plan for new PhD students that will be able to follow a co‐supervised Doctoral formation between TU Delft Applied Mathematics PhD programme and Universidad EAFIT Mathematical Engineering PhD Programme. In cooperation with Universidad de Antioquia we propose the evaluation of models WRF/OPEN LOTOS‐EUROS on the characterization of daily cycle for meteorology and pollutants dispersion in Valle de Aburrá (Aburrá Valley) also the study of Scenary for the Aburrá Valley and its environmental implications through WRF/OPEN LOTOS‐EUROS. Coupling and static/dynamic downscaling of the models are challenging task depending on models and data availability. Measurement of Data Impact in models and Data Analysis In cooperation with TNO and Siata we are about to develop a methodology for measurement of the Data Impact in Models without Assimilation or after the assimilation. The data analysis becomes an important framework to find certain dynamics on the meteorological and chemical profiles of our Domain. Recently, has been a lot of attention regarding the measurement of the impact of the observations (data) over the proper performance of a Data Assimilation Scheme in the enhancement of a model. Several works regarding the quanti cation of the impact of data in reservoir modeling for subsurface applications (Krymskaya, 2013), inclusion of physical phenomenon into the constraints to the problem (Tijana et al, 2014) or the observation impact analysis in storm surge problems (Verlaan and Sumihar, 2016) show evidence about the feasibility to develop new and improved mathematical analysis tools and its algorithms for Data Assimilation stages regarding the solution of a specific problem.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Diversidad genómica y potencial ecológico de los principales organismos mucinófilos de la microbiota intestinal colombiana
    Inicio: Enero  2019 Fin: Diciembre  2020 Duración 
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Red de Laboratorios Regionales para el fortalecimiento de la prestación de servicios científicos y tecnológicos enfocada en la atención a problemáticas asociadas con agentes biológicos de alto riesgo para la salud humana
    Inicio: Agosto  2020 Duración 
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Aunar esfuerzos entre el Instituto Alexander von Humboldt y la Universidad EAFIT para caracterizar la diversidad funcional de bacterias y realizar la caracterización taxonómica y genética de bacterias cultivables de las muestras ambientales
    Inicio: Noviembre  2020 Duración 
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Estudio 3D +1 de polución atmosférica: Mediciones In situ, en Superficie, de Detección remotA y Modelación atmosférica
    Inicio: Enero  2020 Duración 
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Ensamble de modelos para estimar la exposición humana a contaminantes atmosféricos
    Inicio: Enero  2020 Duración 
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Modelos de exposición humana a la contaminación atmosférica en áreas urbanas como herramienta de toma de decisiones (Exposure to Pollutants Regional Research ExPoR2)
    Inicio: Enero  2020 Duración 
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Construcción de inventarios ecológicos para la gestión sostenible de los agroecosistemas de las unidades productivas de aguacate Hass
    Inicio: Octubre  2019 Fin: Octubre  2020 Duración 
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Comunicación de las ciencias a niños y jóvenes en un contexto universitario: sistematización del pro
    Inicio: Enero  2016 Fin: Diciembre  2016 Duración 
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Identificación de especies nodriza en el desierto de La Tatacoa
    Inicio: Febrero  2016 Fin: Diciembre  2016 Duración 
    Resumen

    El estudio de la estructura y distribución espacial de comunidades biológicas puede revelar interacciones intra e interespecíficas. El fomento de interacciones positivas (p.e. cooperación) puede contribuir a la regeneración ecosistémica. Los ecosistemas de bosque seco tropical y bosque muy seco tropical se ven amenazados por procesos de desertificación acelerados por usos inadecuados de los suelos y por cambios climáticos. La identificación de especies nodriza, aquellas especies pioneras que facilitan el establecimiento de especies adicionales, puede elucidar estrategias de manejo ambiental que contrarresten los procesos de desertificación y promuevan la regeneración y conservación de ecosistemas vulnerable. Mediante análisis de estructura poblacional y distribución espacial de especies de plantas vasculares en el Desierto de La Tatacoa (bosque muy seco tropical), este proyecto busca identificar interacciones ecológicas que puedan convertirse en los primeros eslabones de proyectos de regeneración ecosistémica.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Estudio de los mecanismos moleculares del paradigma de multicelularidad en la cepa Bacillus subtilis EA-CB0015
    Inicio: Enero  2016 Fin: Diciembre  2016 Duración 
    Resumen

    La comprensión de cómo la diferenciación celular está regulada en el genoma de B. subtilis ha planteado la búsqueda de posibles cambios genéticos a gran escala tales como deleciones, inserciones nucleotídicas y otros rearreglos genómicos; o incluso cambios a pequeña escala como polimorfismos de un solo nucleótido. El potencial de cepas de Bacillus para sintetizar metabolitos con actividad antifúngica y antibacteriana se ha utilizado en el control biológico de fitopatógenos en plantas, sustituyendo el uso de pesticidas químicos. Extensivos estudios han sido realizados en la Universidad EAFIT con la cepa de B. subtilis EA-CB0015, los cuales han demostrado que esta bacteria tiene un gran potencial para producir compuestos antimicrobianos, sin embargo cambios en la morfología de la colonia han sido observados despues de replicas suscesivas del cultivo. Es por eso que pretendemos dilucidar alguno de los mecanismos moleculares que conducen a la variación morfológica de la cepa Bacillus subtilis EACB015 en los procesos fermentativos. Así, contribuir al entendimiento de sobre los mecanismos involucrados en la multicelularidad de esta bacteria en cuanto a su ecología y evolución.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Caracterización del viroma y bacterioma de las especies urbanas y periurbanas de murciélagos (Orden Chiroptera) dominantes en el Valle de Aburrá para la identificación de microorganismos con potencial zoonótico - Fase 1
    Inicio: Enero  2017 Fin: Diciembre  2017 Duración 
    Resumen

    Las enfermedades emergentes de carácter zoonótico representan un riesgo global en aumento, en parte a raíz de la expansión de las áreas urbanas hacia zonas rurales o silvestres y del calentamiento global. Los murciélagos (Orden Chiroptera) son considerados un grupo de gran potencial zoonótico. Distintas especies de murciélagos han sido identificadas como portadoras, y en algunos casos transmisoras, de virus como el virus de la Rabia, el Nipah y el Hendra, el Coronavirus del SARS y del MERS, y otros virus capaces de infectar poblaciones humanas. En murciélagos se han revelado una gran diversidad de virus previamente desconocidos, incluyendo nuevos serotipos de Influenza A. Igualmente se ha identificado a los murciélagos como portadores de especies de bacterias como Leptospira, Bartonella, Rickettsia y Campylobacter, capaces de causar enfermedades zoonóticas. El estudio metagenómico de las comunidades virales y bacterianas asociadas con murciélagos ha ampliado la capacidad de identificación de virus y bacterias, permitiendo descubrir en ellos nuevos agentes con potencial zoonótico.El proyecto propone caracterizar, mediante estudios metagenómicos de virus y bacterias, el potencial zoonótico de las principales especies de murciélagos de las zonas urbanas y periurbanas del Valle de Aburrá. Este objetivo constituye una prioridad para: 1) La identificación temprana de posibles agentes zoonóticos a los estén expuestos los residentes de Medellín y del Valle de Aburrá 2) La construcción de una base de datos que permita la implementación de programas de monitoreo de agentes zoonóticos de la región 3) El desarrollo de planes de manejo ambiental adecuados que salvaguarden la salud humana y preserven las funciones ecosistémicas de las especies silvestres involucradas. El presente proyecto representa el primer esfuerzo en su estilo a nivel nacional. Con los resultados obtenidos se contribuirá a la preservaciónde la salud humana. Simultáneamente, se contribuirá al desarrollo y posicionamiento científico de la universidad y del país mediante la formación de un estudiante de maestría, la generación de datos genómicos y poblacionales de los animales colectados, y la caracterización de los microbiomas de especies de murciélagos hasta el momento no estudiadas desde dicha perspectiva.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Evolución dirigida en cianobacterias y microalgas que favorecen la producción de energía en radiación infrarroja
    Inicio: Febrero  2017 Fin: Noviembre  2017 Duración 
    Resumen

    Gracias a la fotosíntesis las plantas, algas y cianobacterias, obtienen la energíanecesaria para vivir. La membrana de los tilacoides es donde se lleva a cabo el proceso de fotólisis y de fotosíntesis. Allí se encuentran los fotosistemas, que son un complejo constituido por gran cantidad de proteínas y plastoquinonas, donde transforman la energía por medio de un proceso complejo entre varios de éstos, un complejo antena que capta la energía lumínica y se transforma en energía química que se transfiere y circula hacia el centro de reacción encargado de generar dos gradientes uno de protones y otro eléctrico (Goldschmidt-Clermont Michel et al 2015). La evolución dirigida tiene como finalidad generar proteínas modificadas con variabilidad genética, utilizando como metodología la selección por medio de ciclos de mutaciones sucesivas, hasta encontrar una proteína que se adapte a las condiciones ofrecidas (et.al, 2010). Es por esto que este proyecto tiene como finalidad evaluar la respuesta frente a diferentes longitudes de onda dentro del espectro infrarrojo de microalgas y cianobacterias mutadas por medio de rayos-X. A partir de lo mencionado anteriormente, se pretende obtener mutantes, mediante rayos- X, capaces de utilizar longitudes de onda dentro del rango infrarrojo para realizar fotosíntesis, para de esta manera caracterizar las dinámicas de crecimiento de los mutantes adquiridos a diferentes longitudes de onda dentro del rango 700nm-850nm.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Estudios de la biología y distribución de la especie invasora Ojo de Poeta (Thunbergia alata) en el área de influencia del Parque Arví para el diseño de estrategias eficaces y optimizadas de control y manejo
    Inicio: Marzo  2017 Fin: Mayo  2017 Duración 
    Resumen

    La planta Thunbergia alata (Ojo de Poeta) se encuentra ampliamente distribuida en el Corregimiento de Santa Elena (Municipio de Medellín), incluyendo en el Parque Regional Ecoturístico Arví. T. alata ha sido catalogada por el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt como de alto potencial invasivo en el territorio colombiano. La Corporación Autónoma Regional de las Cuencas de los Ríos Negro-Nare (CORNARE) ha determinado que T. alata debe ser controlada y erradicada (Circular No. 29 del 20 de Noviembre de 2015). En este sentido, La Corporación Parque Arví es responsable por el control y la erradicación de T. alata dentro de las zonas de influencia de Santa Elena, el cual requiere efectuar manualmente, dada la prohibición a la utilización de herbicidas en reservas hídricas. Consecuentemente, para optimizar el uso de recursos y la efectividad de las campañas de control, es necesario identificar prácticas de manejo del material vegetal recolectado de dicha especie invasora que garanticen su inocuidad. De igual manera, es necesario caracterizar los tiempos y frecuencias de retoño y de germinación del banco de semillas de T. alata en las áreas despejadas, con el fin de identificar los tiempos de revisión más efectivos para su continua supresión. Este proyecto busca satisfacer dichos vacíos en el conocimiento sobre el ciclo de vida de T. alata en el Parque Arví y sus interacciones ecológicas en el ecosistema, buscando contribuir al desarrollo de estrategias efectivas de erradicación y supresión, y documentar la magnitud del impacto actual.